יו"ר המועצה האזורית שומרון, גרשון מסיקה, אשר נכנס לתפקידו לפני זמן קצר החליט לציין את חנוכה דווקא בקבר יוסף בשכם. במקביל להדלקת הנר הראשון בתוככי שכם הדליק ראש הממשלה, אהוד אולמרט, נר ראשון של חנוכה לא רחוק משם, בחטיבה המרחבית שומרון.
מסיקה הגיע אל המקום יחד עם ארבעה עשר חברים וידידים בהם גם בני קצובר, שכנו של מסיקה מן היישוב אלון מורה וראש מועצה לשעבר.
"העם היהודי שואב את כוחו ממקום קדוש זה. הדלקת נרות החנוכה במקום קדוש זה היא בבחינת הפצת האור היהודי ,הנחישות היהודית והאמונה בצדקת הדרך", אמר מסיקה שם במתחם הקבר שננטש על-ידי ישראל באוקטובר 2000. "עלינו להחזיק במקום זה ללא מורא ולאפשר הגעה של כל החפצים ללא חשש", ציין.
הביקור בקבר יוסף התאפשר הודות לאישור שניתן על-ידי צה"ל ואבטחת כוחות הביטחון שאיפשרו למתנחלים להיכנס לשכם ולצאת ממנה בשלום.
הקבר ננטש לאחר מות השוטר מדחת יוסף עם תחילת אינתיפאדת אל-אקצה, ביום הראשון של ראש השנה תשס"א (אוקטובר 2000), הותקף מתחם קבר יוסף על-ידי פלשתינים. במהלך המתקפה נפגע שוטר מג"ב, מדחת יוסף, ודימם למוות במשך הניסיונות לתאם את חילוצו עם המשטרה הפלשתינית.
בשבת שלאחר מותו של מדחת יוסף, התפנה צה"ל מהאתר לא לפני שהפלשתינים הבטיחו לכבד את קדושת המקום ולא להרוס אותו. ההבטחה לא קויימה ולאחר פינוי הקבר, הרסו הפלשתינים את המתחם והקימו במקומו מסגד.
תושב אלון מורה, הלל ליברמן, שמע על כך שצה"ל נטש את הקבר ויצא בצעדה פרטית אליו, ונרצח בדרך.
מאז מבצע חומת מגן נמצא קבר יוסף בשליטה ביטחונית ישראלית כמו שכם כולה, אולם אין נוכחות קבועה של צה"ל במקום.
חסידי ברסלב מקיימים ניסיונות חוזרים ונשנים של חדירה למקום, תוך סיכון חייהם. מדי פעם מארגן הצבא כניסה של יהודים למתחם הקבר, בליווי כוחות צה"ל.
