ראש הממשלה אהוד אולמרט אמר כי הדוח שהוגש לו ולשר הביטחון אהוד ברק הוא קשה ומורכב, ומעיד על גזרות מאוד בעיתיות בתפקוד החברה הישראלית, בדרגים המדיניים ומערכות הביטחון שלנו לצד גילויים בלתי רגילים שמעידים על גבורה, על תעוזה, על לחימה מפוארת ועל אומץ לב בלתי רגיל של יחידים וקבוצות שאפיינו תמיד את צה"ל ואת לוחמי ישראל ואפיינו אותם גם במלחמת לבנון האחרונה.
אולמרט, שדיבר בפתח ישיבת הממשלה (03.02.08), אמר שהדוח הזה הוא לא מקור לשמחה. "לא הייתה כזאת בשום מקום, וודאי לא אצלי", אמר ברומזו לדיווחים לפיהם הורמו כוסות שמפניה בלשכתו לאחר הודעת השופט וינוגרד. "הדוח הוא מקור ואפשרות להזדמנות - הזדמנות לתקן דברים שנחשפו, שנתגלו, לשפר אותם, לבנות מחדש במידת הצורך ולהוביל את מדינת ישראל קדימה כדי שתהיה ערוכה כראוי בכל הגזרות הביטחוניות, החברתיות והמדיניות להתמודד עם האתגרים שהיא צריכה להתמודד איתם".
הוא אמר לשרים כי כשקיבל לידיו את הדוח הקודם, הורה על תהליך מסודר של הפקת לקחים, במערכות הציבוריות והמדיניות. "מהיום הראשון שלאחר הפסקת הלחימה התחיל צה"ל אז בפיקודו של רב אלוף חלוץ ושר הביטחון עמיר פרץ, וביתר-שאת מאז מינויו של הרמטכ"ל גבי אשכנזי וכניסתו לתפקיד של שר הביטחון ברק להפיק לקחים, לשפר דברים, ללמוד מטעויות, להיערך כראוי כדי להכין את מערכת הביטחון על-מנת שהיא תוכל להתמודד כהלכה עם המשימות שמוטלות עליה".
אולמרט הוסיף מחמאה סמויה לשר הביטחון שבחר לא לפרוש מהקואליציה, ואמר כי יש לו אמון מלא ביכולת של מערכת הביטחון בראשותו של השר אהוד ברק ובפיקודו של גבי אשכנזי, כדי לטפל כהלכה בבעיות שהתעוררו ולערוך את צה"ל לכל אתגר ולכל תרחיש איום שיהיה בעתיד. "מטבע הדברים הממשלה תעסוק בדוח... כפי שהדוח אומר באופן ברור ביותר: לצד כשלים היו הישגים, לצד טעויות היו הצלחות חשובות למדינת ישראל. אנחנו חייבים לא להפריז בהישגים ולא להמעיט מהכשלים אלא להתייחס אליהם בדרך הרצינית, בכובד הראש הראוי ובעיקר לזכור שתמיד תמיד יש כאלה שמשלמים מחירים אישיים כבדים מנשוא שאיתם הם צריכים לחיות לתמיד", דברי אולמרט.
