במהלך דיון ועדת העלייה, הקליטה והתפוצות (יום ב', 3.3.08) הובהר לוועדה כי הממשלה קיבלה רק באופן חלקי את דוח חלפון, תיקנה בו כ-12 שינויים מהותיים, והתוצאה עלולה להביא להדרת רגלי 300,000 יוצאי בריה"מ לשעבר מהליך הגיור.
מנכ"ל המשרד לקליטת העלייה, ארז חלפון, הציג את דוח הוועדה בראשותו בנושא רפורמה במערך הגיור, מהדוח עולה כי עלות פעילות הגיור בשנת 2007: 42.5 מיליון ש"ח. ומספר המתגיירים עומד בממוצע על כ-2000 לשנה. חלפון ציין כי הוועדה למדה את הנושא משך כ-8 חודשים והמליצה להקים יחידה עצמאית במשרד ראש הממשלה- אותה דחתה הממשלה. בנוסף, המליצה הוועדה על הפעלת 50 דיינים רבנים בהתנדבות, ללא שכר -אך היועץ המשפטי לממשלה לא אישר זאת.
חברי הכנסת שנכחו בדיון טענו כי החלטת הממשלה לדחות את מימצאי דוח חלפוןרק תחריף את בעיית הגיור ותסרבל את הטיפול בעולים, לכן קראו חברי הוועדה לקבל את חלפון במלואו. ח"כ מיכאל נודלמן (קדימה), ציין כי רבים מיוצאי בריה"מ לשעבר שאינם יהודים עפ"י ההלכה -סבלו רדיפות טרם עלייתם בשל נישואיהם ליהודים "העובדה שעלו לישראל מעידה שהם מרגישים חלק מן העם היהודי ואין מקום להקשות עליהם בהליך הגיור".
גם חברת הכנסת מרינה סולודקין (קדימה) הביעה מחאה נמרצת נגד החלטת הממשלה. לדבריה, כתוצאת קשיים בהליך הגיור "במתכונת הנוכחית לא יהיו גיורים כלל". לטענותיה הצטרף ח"כ יולי אדלשטיין, יו"ר השדולה להסדרת נושא הגיור שטען כי היתה תקווה שהוועדה תביא לשינוי משמעותי, אבל הממשלה סרסה את מסקנות הוועדה. "אני דורש את יישום מסקנות וועדת חלפון כלשונן וקיום דיון נוסף בוועדה בנוכחות ראש הממשלה ונציגי משרדו על-מנת שיסבירו את הסתייגויותיהם מהדוח". דרש אדלשטיין.
הצטרף לחברי הכנסת המוחים ח"כ דוד רותם וטען נגד הממשלה: "הרי אין לכם עניין לגייר אנשים כלל". רותם הוסיף ואמר כי "מונחת כאן פצצה שאם לא נטפל בה תתפוצץ מתחת לרגלנו". בניגוד לקולות חברי הכנסת המוחים ציין ח"כ הרב משה גפני (יהדות התורה) כי במהותו הגיור אינו ידידותי. "כדי להצטרף לעם היהודי צריך לעבור הליך קשה". בסיכום הדיון קראה הוועדה לממשלה לבטל לאלתר החלטתה בעניין הגיור, ולקבל במלואן את מסקנות ועדת חלפון.
