בישיבת מרכז הרב בירושלים הותקפה מילולית שרת החינוך יולי תמיר. לאחר ביקור טעון בישיבה לצעירים פנתה אל עבר הספריה בה בוצע הטבח, ונתקלה בהתנגדות מצד תלמידי הישיבה.
ראשי הישיבה הפצירו בה להימנע מלהמשיך לישיבה הגבוהה, אך היא בחרה להמשיך בסיור. עשרות תלמידים ואנשים כואבים אחרים ששהו במקום ביקשו ממנה לעזוב את המקום ואמרו כי היא מתנכלת בקביעות למגזר הדתי. מקצתם התפרצו לעברה בקריאות זעם וכינו אותה: "פושעת", "רוצחת" ו"נציגת 'שלום עכשיו' שמייבשת את כל התקציבים לחינוך הדתי". הם שאלו בקול: "למה הבאתם אותה לכאן?". משנוכחה כי ביקורה במקום נתפש כפרובוקציה, פנתה ללכת בליווי כבד של כוחות משטרה.
בקבוק פלסטיק שהושלך לעברה פגע בגבו של מאבטח, ובסיוע השוטרים שבה השרה לרכבה.
"כשרת חינוך אני צריכה לבוא למקום האסון בו נרצחו התלמידים. בפגישה עם צוות הישיבה לצעירים התרשמתי שיש אנשים נסערים, ובצדק. היה ביקור מאד רגוע. כמו שאפשר להניח כשמגיעים למקום שנרצחו בו שמונה אנשים זה היה מאוד מרגש. מחוץ לספריה היה אספסוף שנהג ללא כבוד לנרצחים. ראשי הישיבה אמרו לי שהם לא שייכים למקום. אני מצטערת שהייתה התלהמות, זו בעיה שלהם ולא שלי", אמרה השרה בתום הביקור.
קודם לכן ביקר במקום השר לביטחון פנים. בניגוד לביקורה המתוקשר של תמיר, היה ביקורו של השר אבי דיכטר סגור לתקשורת ועבר בשקט. לדברי אנשי דיכטר, הביקור היה מכובד ונועד למטרות תנחומים. דיכטר ביקר בישיבה גם שלשום ואף הורשה להיכנס לספרייה.
מבית-החולים שערי צדק שולחו לבתיהם שניים מפצועי הפיגוע בישיבת מרכז הרב. בבית-החולים מאושפז עדיין תלמיד הישיבה תושב שדרות, שמצבו מוסיף להיות קשה ועוד פצוע, שמצבו קל. בבית-החולים הדסה עין כרם מאושפזים שלושה פצועים מהפיגוע - שניים במצב בינוני ואחד במצב קל.
