בבית העלמין קריית שאול בתל אביב ייטמן מחר (יום ב') יוסף (טומי) לפיד. לבקשת בני משפחתו הוא ייקבר בלוויה עם סממנים דתיים.
במהלך הקריירה הפוליטית-ציבורית-עיתונאית שלו לחם לפיד נגד הדתיים, והוגדר כ"אנטי דתי". רבה של תל אביב ישראל מאיר לאו אמר כי "טומי הדגיש תמיד שהוא לא נגד הדת ולא נגד הדתיים, אלא שולל כפייה דתית".
חברו הרב ישראל אייכלר אמר כי לפיד טרח להגיש את יהדותו, וציין כי הייתה זו יהדות בצל השואה. לדבריו, לפיד לא כפר בגלל השואה, וגם אביו וסבו לא היו דתיים. אייכלר סיפר כי טומי אמר לו שיש לו ויכוחים עם בנו יאיר שמגדיר את עצמו כאדם מאמין.
על יהדותו של לפיד אמר הבוקר בפתח ישיבת הממשלה ראש הממשלה אהוד אולמרט: "אני רוצה לומר שטומי לפיד היה יהודי בכל רמ"ח אבריו. נכון שהוא מעולם לא ייחס חשיבות לגינונים הטקסיים שקשורים ביהדות ולא פעם מתח עליהם ביקורת חריפה שהעמידה אותו בעימות מול גורמים ציבוריים ופוליטיים הקשורים בדבר הזה. טומי היה פליט שואה שכל חייו חי את חוויית השואה, שכל חייו חי את חוויית הרקע היהודי, הגורל היהודי, ההיסטוריה היהודית והעתיד היהודי ועתידה של מדינת ישראל כמדינה יהודית במציאות האכזרית והקשה שאיתה התמודדנו.
"זה לא פלא שאני חשבתי שאין ראוי ממנו להיות יו"ר המועצה הציבורית של 'יד ושם' והממשלה אישרה את מינויו ורק לפני שבועות ספורים הוא היה כאן בישיבת ממשלה, מלא אופטימיות, מלא עוצמה ומלא תקווה שהוא יוכל להמשיך ולפעול בתחומים הללו על-פי מיטב ההכרה היהודית שהייתה חלק בלתי נפרד מחייו", דברי אולמרט.
פוליטיקאים דתיים וחרדיים מיעטו להתבטא בעניין פטירתו. ח"כ זבולון אורלב מהמפד"ל הביע צער על מותו ואמר שחיזק את הדמוקרטיה בישראל.
בפורום "בחדרי חרדים" ביטא את דבר הקבורה היהודית אחד הגולשים, בצורה ממצה: "חג כגוי ומת כיהודי".