ראש הכנסייה הרוסית האורתודוכסית הפטריארך אלכסיי ה-2, שהנהיג את תחיית הכנסייה בתקופה שלאחר נפילת ברית המועצות והואשם בהפיכתה לכוח של לאומנות, מת (יום ו', 5.12.08), בן 79.
הפטריארכט של מוסקבה הודיע כי הפטריארך מת במעונו שליד מוסקבה, אך לא מסר מה סיבת המוות. ידוע כי אלכסיי לקה זמן רב בלבו.
אלכסיי התמנה לעמוד בראש הכנסייה ב-1990, בעת שבריה"מ האתיאיסטית החלה לרופף את ההגבלות על הדת. לאחר שבריה"מ התמוטטה בשנה שלאחר מכן, גאתה הפופולריות של הדת. כיפות הכנסיות, שבתקופה הקומוניסטית הוסר מהן ציפוי הזהב, צופו מחדש בזהב, מבנים של כנסיות שהוסבו למחסנים או נותרו נטושים הוחזרו לתפקידם הדתי, ומיסות הנמשכות שעות וחגים דתיים גדולים שודרו בשידור חי בטלוויזיה.
בזמן מותו של אלכסיי, נאמד צאן מרעיתו בכנסייה הרוסית בשני שלישים מ-142 מיליון התושבים. זוהי הכנסייה האורתודוכסית הגדולה בעולם.
אבל אלכסיי התלונן לעתים תכופות כי חופש הדת ברוסיה מעמיד את הכנסייה בלחצים חמורים, והתמרמר על ניסיונותיהן של כנסיות נוצריות אחרות לנגוס בקהל מאמיניו. תלונות אלה התמקדו בכנסייה הקתולית. אלכסי סירב לאפשר ביקור של האפיפיור ברוסיה אם לא ייושב סכסוך המרת הדת.
אלכסיי הספיק לזכות בחייו ליישוב סכסוך דתי גדול אחר. ב-2007 חתם על חוזה עם המטרופולין לאורוס, מנהיג הכנסייה האורתודוכסית הרוסית הלבנה שהתקיימה בגלות, ועל פיו התהדקו הקשרים בין שתי הכנסיות. הכנסייה הלבנה, שמרכזה בארה"ב, התפלגה מהכנסייה הראשית, האדומה, ב-1927, לאחר שמנהיג הכנסייה במוסקבה הכריז על נאמנותו לממשלה הקומוניסטית.
אלכסיי פעל בהצלחה למען חקיקה של חוק דת ב-1997 המטיל הגבלות על פעילותן של דתות שאינן אורתודוכסיות - כגון איסלאם, יהדות ובודהיזם. תחת הנהגתו, התנגדה הכנסייה האורתודוכסית בתקיפות לכנסייה האורתודוכסית הפורשת באוקראינה השכנה, ודרשה כי הכנסייה האוקראינית תישאר תחת פיקוחה של מוסקבה.
בנו של כומר מאסטוניה הפטריארך אלכסיי ה-2 נולד ב-23 בפברואר 1929 בטלין שבאסטוניה. שמו היה אלכסיי מיכאילוביץ' רידיגר. אלכסיי, שהיה בנו של כומר, התלווה לעתים מזומנות להוריו במסעי הצליינות שלהם לכניסות ולמנזרים, וסייע לאביו לתת שירותי דת לשבויים במחנות הריכוז הנאציים באסטוניה במלחמת העולם השנייה.
תחת שלטון בריה"מ, הייתה הכנסייה האורתודוכסית נתונה לדיכוי של לנין וסטלין ואלפי כנסיות נהרסו או הוסבו לשמש למטרות אחרות כגון מוזיאונים המוקדים לאתיאיזם או אפילו אורוות. רבים מהכמרים נרדפו על אמונתם.
הרדיפות זכו להפוגת מה בימי מלחמת העולם השנייה, כאשר גילה סטלין כי ניתן להשתמש בכנסייה ככלי תעמולה נגד הנאצים. אבל השלטונות הסובייטיים מעולם לא רופפו את אחיזתם, וחדרו לשורות הכנסייה גם בדרגים הבכירים.
אלכסיי החל לשמש כומר ב-1950 והתקדם בהיררכיה האורתודוכסית. הוא הושבע לבישוף של טאלין ואסטוניה ב-1961.
מכון המחקר הבריטי קסטון העוקב אחרי חופש הדת במדינות הקומוניסטיות לשעבר, אומר כי נראה שהקריירה של אלכסי נעזרה לא מעט בסיוע שנתן לקג"ב בעת שהיה כומר צעיר בטאלין. הכנסייה מכחישה האשמות אלה.