הודו העבירה (יום ב', 5.1.09) לפקיסטן את הראיות המפורטות ביותר עד כה שלדבריה קושרים "אלמנטים" בפקיסטן לפיגועים במומבאי. כך הודיע משרד החוץ בניו דלהי.
הודו טענה כל העת כי הפיגועים שהיו בנובמבר, ושנהרגו בהם 164 בני אדם, היו מעשי ידיהם של קיצונים פקיסטנים, אך פקיסטן הכחישה את ההאשמות ודרשה הוכחות.
הראיות שנמסרו לשגריר פקיסטן בניו דלהי כוללות חומר חקירה של הטרוריסט היחיד שנתפס חי, פרטים על שיחות טלפון בין הטרוריסטים לבין מפעיליהם בפקיסטן, נשק שנתפס, ונתונים מטלפונים לווייניים.
בהודעת משרד החוץ ההודי נאמר: "אנו מצפים שממשלת פקיסטן תפתח מייד בחקירות נוספות ותשתף אותנו בתוצאות כדי להביא את האחראים לדין".
דובר משרד החוץ של פקיסטן מוחמד סדיק, אמר כי השלטונות בודקים את הראיות. הוא סירב לפרט.
הודו טוענת כי את הפיגועים ביצע ארגון לשקר א-טייבה, הפועל בפקיסטן. השלטונות הפקיסטניים עצרו לפחות שניים מאנשי הארגון, באשמה שתכננו את הפיגועים, וכן פשטו על סניפיו של ארגון צדקה שכנראה היה מיסווה לארגון לשקר.
הודו דרשה מפקיסטן להסגיר לידיה את החשודים ולפרק את רשת הטרור הפועלת בתחומה. ואולם פקיסטן אומרת כי תשפוט את כל החשודים בבתי המשפט שלה.
הודו: חשד שהטרוריסטים קשורים לשלטונות הממונה על הביטחון בהודו, שר הפנים פלניאפן צ'ידמברם, אמר כי הוא חושד שלטרוריסטים היו קשרים לא רק עם ארגון הפועל בפקיסטן אלא גם עם שלטונות פקיסטן. "למעשה, אני מניח שהם סוכני מדינה או סוכנים בסיוע המדינה עד שיוכח ההיפך. שום אדם שאין מדינה מאחוריו אינו יכול לבצע מתקפה כזאת", אמר צ'ידמברם בראיון ביום א' לערוץ החדשות NDTV.
המחלוקת בין הודו לבין פקיסטן סביב הפיגועים במומבאי, גרמה להעברת כוחות של צבא פקיסטן מאזור השבטים בצפון מערב המדינה, ליד גבול אפגניסטן, אל הגבול עם הודו. העברת הכוחות פגעה במאמצי צבא פקיסטן להשיג שליטה באזור השבטים. ביום ב' התגלו באזור זה שלוש גופות מנוקבות בכדורים, ולדעת המשטרה המקומית אפשר שהיה זה מעשה ידי הטליבאן. השלושה היו קבלן בניין פקיסטני ושני אפגנים, שהטליבאן טען כי הם מרגלים לטובת ארה"ב.
עוזר שרת החוץ של ארה"ב, ריצ'ארד באוצ'ר, בא ביום ב' לאיסלמאבאד ונועד עם מנהיגי פקיסטן, ובהם יוסוף ראזא גילאני. גילאני מסר כי הבטיח לבאוצ'ר ש"פקיסטן לא תניח להפעיל מאדמתה כל סוג של טרור". עוד אמר כי "כדי ליצור סביבה מועילה, מוטב שפקיסטן והודו יפתרו סוגיות ליבה, כגון קשמיר".
