במתקפה חריפה יצא הבוקר (יום ד', 21.1.09) היומון החרדי "יתד נאמן", נגד ההיתר שנתנו הרבנים הראשיים להעתיק את הקברים מבית חולים ברזילי כדי לבנות אגף חדש שעשוי להציל חיים. תחת הפתיח: "פסק הלכה בדבר הקברים שנתגלו ליד בית החולים באשקלון", נכתב כי "הלכה פסוקה היא שאסור לפנות שכונת קברים שבהם מת ומושכב כדרכו, וזאת אפילו אילו היה מדובר בפינוי הנעשה כראוי בידי בעלי יראת שמים העושים לפי ההלכה".
הפסק, עליו חתומים שניים מגדולי הרבנים החרדיים - שמואל הלוי וואזנר ונסים קרליץ, יוצא נגד הנחת היסוד שמאחורי ההיתר לפינוי הקברים, ונכתב בו ש"אין שום מקום להיתר על פיקוח-נפש בדבר שתועלת הצלתו תבוא רק כעבור זמן רב לאותם שיצטרכו אז, כשאין בו הצלה לאותם הנזקקים כעת". עקיצה חריפה נשלחה גם לעבר הרבנים הראשיים לישראל שלמה עמאר ויונה מצגר, שהתירו את העתקת הקברים מטעמי פיקוח-נפש: "והזכרת היתר פיקוח-נפש לדברים עתידים האלה הוא סילוף שיש בו עקירת התורה".
את דבריהם סיכמו הרבנים במילים: לפי מה ששמענו שישנה אפשרות לבנות את בית החולים בצד אחר שבו לא תהיה פגיעה בקברים, הרי שכל הדיון הוא ללא צורך".
הרב אלישיב הצטרף לדברים אלו הצטרף מנהיג הפלג הליטאי, הרב יוסף שלום אלישיב, שצירף את חתימתו, וכתב לידה: " על-פי הבירורים והנתונים שהוצגו בפני, אין מקום להתיר לפנות המתים ממתחם בית החולים באשקלון, ויש להקים את האגף החדש בצורה שלא יפגעו בבית הקברות". בכך יוצא למעשה הרב אלישיב חזיתית נגד הרב יונה מצגר, לאחר שפעל למינויו לרב ראשי.
מחלוקות פנימיות ב"יתד נאמן" מסתמכים על ארגון בשם "האיגוד למניעת חילול קברים" בבואם לקבוע את פסק ההלכה. הארגון המקביל "אתרא קדישא" של "העדה החרדית" אינו מוזכר בשל יריבויות פנימיות עם הרב דוד שמידל העומד בראשות "אתרא קדישא" על כך שאינו נשמע כביכול למרות גדולי התורה. ביומון יצאו לאחרונה נגד הרב הראשי עמאר בשל כוונתו להקים אגודת רבנים. החשש הוא כי מדובר בגוף לא מוכר ביהדות שיפסוק הלכות. הרב עמאר טען כי מדובר באיגוד מקצועי, אך דבריו נפלו על אוזניים ערלות. בסביבתו רומזים כי קיים קשר לעובדה שהרב משה ראוכברגר מחיפה אינו רוצה ארגון שיתחרה בארגון רבני השכונות שהקים, ופועל כביכול באמצעות בנו אליעזר המשמש ככתב פרלמנטרי בעיתון.
