ועדת החקירה למשבר המים נחשפה (יום ד', 21.1.09) לתמונה עגומה: דלקים זולגים ממיכלים בתחנות דלק ומזהמים קרקעות ומים, שפכים של מחנות צה"ל אינם מטופלים, ומי שאמורים היו לטפל בנושאים אלו - המשרד להגנת הסביבה ורשות המים - מתקוטטים על סמכויות.
הוועדה החלה לשמוע עדויות של משרדי ממשלה בנוגע לטיפול במקורות המים וכיצד מונעים זיהומי קרקע ומים. המשרד טען בעדות כי אחד מהגורמים המזהמים ביותר במדינה הוא משרד הביטחון וצה"ל אך הדבר טרם טופל.
בין היתר מדובר ב-250 תחנות דלק של צה"ל שבהן יש מיכלים תת-קרקעיים. כמו-כן, מדובר בנושא השפכים במחנות צה"ל שאינו מטופל. המשרד מסר כי נעשתה פנייה בנושא לשר הביטחון ולרמטכ"ל, אך לא היה מענה. המשרד אומד את היקף ההשקעות הנדרשות לפתרון הביוב במחנות צה"ל בכ-400 מיליון שקלים.
הסכסוך רב השנים - להכרעת מזוז המדען הראשי של משרד הגנת הסביבה ישעיהו בר אור חשף בעדות כי בין שני הגורמים המופקדים על שמירת איכות המים ומניעת זיהומי מים וקרקע עבר "חתול שחור", והם אינם משתפים פעולה. הסכסוך החמיר עד כדי העברת הסוגייה להכרעת היועץ המשפטי לממשלה כדי שיכריע בנושא הסמכויות.
בעקבות הסכסוך, יש קושי לדבריו להתמודד מול "גורמי זיהום ומול הציבור". דוגמא לכך הוא עניין הטיפול בתחנות הדלק. לדבריו, "בשנים האחרונות נמצאו מאות תחנות דלק שהקרקע, ולעיתים גם המים מתחת לשטח התחנה, מזוהמים בדלק. בשל הימצאות המיכלים מתחת לפני הקרקע, קיים קושי באיתור דליפות של דלק. מרבית הדליפות מתגלות לאחר שמפעילי התחנה מתקינים פיאזומטר כנדרש על-פי תקנות תחנות הדלק. למעשה, בכל תחנות הדלק כמעט ללא יוצא מן הכלל בהן הותקן הפיאזומטר נמצא זיהום, והתחנה חוייבה לטפל בו".
אלא שרשות המים מנעה במשך זמן רב את התקנת המכשיר בטענה כי הם צריכים רשיון קידוח.
דוגמא נוספת לפגיעה הנגרמת מחוסר שיתוף פעולה, שיתוק בקידום התקנת תקנות. בחלק מהמקרים, "הגורמים הנוגעים בדבר בנציבות המים מנעו העברת תקנות המוצעות על-ידי המשרד לדיון במועצת המים. במקרים אחרים, התקנות המוצעות נמסרות למועצת המים, אך זו מסרבת לדון בהם. התוצאה - המשרד להגנת הסביבה אינו יכול לקדם הליך התקנת תקנות בנושאים החשובים לסביבה ולציבור במדינת ישראל".
גורם נוסף המקשה על איתור זיהומי מים וקרקע, הכפילויות באמצעים לאכיפת מניעת זיהומים, צו שיפוטי לטיפול במקור מים מזוהם של המשרד להגנת הסביבה, "צו לתיקון המעוות" של רשות המים, שאמור לתת מענה לנושאים אליהם מתייחס גם הצו השיפוטי למקורות מים מזוהמים. המדען ציין כאמור, כי סכסוך הסמכויות הועבר כבר לפני כ-4 שנים לידי היועץ המשפטי להכרעתו, אך "הוא טרם הכריע בנושא".
