חשיפה לא קבועה למטהרי אוויר אינה גורמת בדרך-כלל לבעיות, כל עוד מדובר בשימוש במוצר על-פי ההוראות.
למרות זאת, הכימיקלים שבמטהרי האוויר עלולים לגרות את העיניים, העור והגרון. שימוש ממושך במטהרי אוויר עלול לגרום לזיהום אוויר בתוך הבית, שעלול לפעמים לעורר אסטמה ובעיות ריאה אחרות.
אם אתם בוחרים להשתמש לאורך זמן במטהרי אוויר, הקפידו לעקוב אחר ההוראות שעל האריזה.
אם אתם סובלים מאסטמה או מבעיות ריאה אחרות, או שאתם פשוט מודאגים מהכימיקלים הנפלטים ממטהרי האוויר, שיקלו אופציות אחרות לרענן את האוויר שבבית.
שימרו על בית נקי, וודאו שהבית מאוורר היטב.
פזרו מעט סודה לשתייה בתחתית פח האשפה. או הניחו פרוסות לימון טריות. זירקו את הזבל בכל יום ותקנו דליפות בגג או בקירות.
