ראש הממשלה אהוד אולמרט פנה לנציב שירות המדינה שמואל הולנדר בדרישה כי ינקוט בהליך של חקירה משמעתית נגד עמוס גלעד, ראש האגף המדיני-ביטחוני במשרד הביטחון. אולמרט מתייחס לדבריו של גלעד נגד אומרט, שפורסמו במעריב. במקביל, הישעה אותו מניהול המו"מ עם המצרים.
במכתב שהפנה מנכ"ל משרד ראש הממשלה בשמו של אולמרט, לנציב הולנדר, נכתב: "התבטאויותיו של מר גלעד, כפי שבאו לידי ביטוי בכתבה, הן חמורות במיוחד ויש בהן משום פגיעה לכאורה ביחסי החוץ של המדינה ובמעמדו של ראש הממשלה".
במכתב שהופץ גם לשר הביטחון אהוד ברק ולמנכ"ל משרד הביטחון פנחס בוכריס נכתב עוד: "מדובר בפקיד בכיר מאוד. ביקורת כזו חמורה שבעתיים והשלכותיה חמורות מאוד", לנוכח העובדה שמדובר בפקיד בכיר שידוע בציבור.
בשבוע שעבר - לאחר ישיבת הממשלה האחרונה, זימן אולמרט את גלעד ואת שר הביטחון אהוד ברק ללשכתו, ונזף בגלעד על דבריו שפורסמו בעיתון מעריב, בהם טען גלעד שישראל העליבה את המצרים וכינה את ניהול המו"מ "טירוף". "ישראל לא מבינה מה היא רוצה בעניין שליט", אמר וטען כי ישראל פוגעת ביחסי האמון ויחסי העבודה עם המצרים. אולמרט לא נותר חייב, והוכיח את לגלעד: "מה שנעשה מעל דפי העיתון הוא מעשה חצוף וגס רוח, שמהווה הפרה של כל הכללים של התנהלות פקיד מדינה כלפי ראש הממשלה. זו התנהגות בלתי נסבלת בממשל מתוקן. אתה יודע מה יחסי אליך ואיזה גיבוי קיבלת ממני, אבל אין שום דרך להצדיק את מעשיך, גם אם אתה חושב כי נעשה לך עוול".
ברק: דרך מוקצנת של ניגוח" ברק נחלץ להגנתו של גלעד, וטען כי הניסיון של אולמרט לתאר את גלעד כשליח אישי של שר הביטחון הפועל בלא סמכות עושה לו עוול. בתגובה למכתבו של אולמרט לנציב, נמסר מלשכת יועץ שר הביטחון לתקשורת: "חבל שראש הממשלה בחר בימיה האחרונים של ממשלה בראשותו, בדרך מוקצנת של ניגוח וניסיון למיצוי דין עם משרת ציבור נאמן ומעולה. במערכת הביטחון מאמינים כי: יש להתרכז בקידום הבאתו של גלעד שליט ובגיבוש הישגי מבצע 'עופרת יצוקה' במקום לעסוק בהתנגחויות פנים ממשלתיות. האלוף (מיל.) עמוס גלעד הינו עובד מדינה מסור ומצטיין עם תרומה של עשרות שנים לבטחון המדינה וידוע ברצינותו, אחריותו ויושרו.
כך פעל לכל אורך דרכו, וכך גם לכל אורך הטיפול בקשר עם מצרים, במהלך ולאחר מבצע עופרת יצוקה, וזאת בהנחיה רצופה ומלאה של 'השלישייה' והקבינט".
