בית המשפט העליון התיר לפרסום (יום ד', 25.3.09) את הדוח הבוחן את ניסוי "עומר 2" שנעשה בחיילים על-מנת לבחון פיתוח של חיסון לנגיף הגחלת [אנתרקס, א.ו.].
בדוח שהותר היום לפרסום נקבע כי חלו כשלים מהותיים בהליך ביצוע הניסוי ובמעקב אחרי החיילים שהשתתפו בו. עוד קבעה הוועדה של ההסתדרות הרפואית כי חלו כשלים אתיים חמורים בהליך הניסוי. בין היתר לא הוזהרו המשתתפים בניסוי מפני תופעות הלוואי האפשריות.
"אין דרך תקיפה דייה להביע הסתייגות והשגות מדרך הגיוס של החיילים לניסוי, מן הליקוי בהסברת הסיכונים למשתתפים, ומכשלים מהותיים במעקב הרפואי אחר החיילים שהשתתפו בו. נדחקו לקרן זווית הנחיות מהותיות בדבר ניסויים בבני אדם", כתבו חברי הוועדה בדוח.
עוד דווח שם כי עשרות חיילים מבין המשתתפים בניסוי לקו במחלות שונות, מקצתן חשוכות מרפא, כמו מחלת הנפילה ודלקות חריפות בדרכי הנשימה ובמערכת העיכול. זאת בזמן שמשרד הביטחון טוען כי רק 11 חיילים התלוננו על תופעות לוואי.
הוועדה שהקימה ההסתדרות הרפואית, שבחנה את הניסויים הוקמה בעקבות פנייה של קצין הרפואה הראשי בצה"ל. מייד לאחר סיום עריכת הדוח בשנת 2008, ניתן צו בית משפט שאוסר על פרסומו. בעקבות עתירות שהוגשו בנושא ולאחר שעיין בו, החליט היום בג"צ כי ניתן לפרסמו.
מדובר בניסוי שבוצע בין השנים 1998 ל-1999 ובמסגרתו חוסנו 716 חיילים בנסיוב חדש שפותח נגד הנגיף.
הפרשה נחשפה לפני כשנתיים בתוכנית עובדה, כשבמהלכה נטען בין היתר, כי עורכי הניסוי לא הביאו בפני המשתתפים בו את המידע אודות הסיכונים וגם לאחר שהחיילים חלו, מערכת הביטחון לא לקחה אחריות ושלחה אותם לטיפולים במרפאות אזרחיות. אחד מהמשתתפים בניסוי טען כי המידע שהם קיבלו לגבי הניסוי הוא כי אינו מסוכן.
מערכת הביטחון טענה כי מדובר במחקר שנערך במסגרת היערכות למיגון אוכלוסיית המדינה מפני איום אסטרטגי, אשר קיבל אישור ועדת הלסינקי ובוצע "תודות להשתתפותם של חיילים מתנדבים, תוך ליווי בטיחותי ורפואי קפדני ביותר, עם הסבר מפורט למתנדב על המחקר ואפשרויות פרישה ממנו בכל עת".
ממשרד הביטחון נמסר מנגד כי המחקר הוצג ל-4029 מתנדבים פוטנציאלים מתוכם 716 הסכימו להשתתף במחקר. כחמישים אחוזים מהמשתתפים במחקר הם משרתי קבע. "למתנדבים ניתן הסבר מפורט אודות החיסון, מהלך המחקר, ותופעות לוואי-אפשריות. למתנדבים ניתן דף לעיון ולחתימת המתנדב. מתוך 716 משתתפי המחקר, 11 חיילים פנו לקבלת סיוע רפואי מאגף השיקום עקב תופעות לוואי. לכל החיילים שפנו ניתן טיפול רפואי. במקביל ממשיך אגף השיקום לטפל בקביעת זכאותם", לשון הודעת משרד הביטחון.
לדברי בכירים במשרד הביטחון ניסוי עומר 2 היה ניסוי בעל חשיבות אסטרטגית לבטחון המדינה. "בזכותו יש למדינה מענה רפואי לאוכלוסיה נגד איום חמור ביותר", אמרו ודחו את הקריאות להקמת ועדת חקירה ממשלתית לבחינת הכשלים בניסוי.
"אנו מודים למתנדבים ומעריכים את הסכמתם להשתתף במחקר חשוב זה ותרומתם לביטחון כלל תושבי ישראל", אמרו.