המדינה טוענת כי יש לדחות את העתירה נגד מתן פרס ישראל למכון לדמוקרטיה. מדובר בעתירה של הפורום המשפטי בטענה כי בשל היכרות וקשריהם של שופטי ועדת הפרס עם המכון, קיים חשש למשוא פנים.
בתגובת הפרקליטות לבג"צ (יום ד', 22.4.09) נטען כי המגע בין המכון לבין חבר השופטים הוא "מצומצם ביותר". כמו-כן יש להבחין בין "ניגוד עניינים אישי" כמו קרבת משפחה, חברות קרובה או קשרים כלכליים "שהוא פסול", לבין היכרות מקצועית קודמת על-רקע עיסוק בתחום הרלוונטי למתן הפרס "שאין בו ניגוד עניינים פסול".
מלבד זאת, טוענת הפרקליטות, "במדינה קטנה כמו מדינת ישראל אין לראות בהיכרות מקצועית, השתתפות משותפת בכנסים מקצועיים וכתיבה אקדמית וכדומה - כיוצרות מצב של ניגוד עניינים פסול. אחרת, ספק אם ניתן יהיה למצוא שופטים בעלי שיעור קומה בתחומם אשר יוכלו לדון בהענקת הפרסים למועמדים".
בתשובתה התייחסה המדינה גם לטיעון בעתירה -
שהתבסס על החשיפה ב-News1, לפיו קיים ניגוד עניינים מבני בעצם מעורבותו של לנגנטל בחלוקת הפרס למכון. בתגובה מודה המדינה כי "מבחינה משפטית, מלכתחילה, היה נכון יותר לו היועץ לשר החינוך לנושא הפרס עו"ד נחום לנגנטל לא היה מעורב באופן כלשהו בפרס ישראל על מפעל חיים. זאת על-מנת למנוע מראית עין או לזות שפתיים. יחד עם זאת, בדיעבד, משהתקבלה ההחלטה על-ידי צוות השופטים פה אחד, כאשר ללנגנטל אין כל מעמד לעניין בחירת מקבלי הפרס, וכאשר קשריהם של השופטים אל המכון חלשים, לא מתעורר חשש לקיומו של ניגוד עניינים". עם זאת, גם אם נפל פגם בהתנהלות ועדת הפרס הוא אינו כזה "היורד לשורשו של עניין" ולפיכך אין בו כדי להצדיק את ביטול הפרס "אשר עלול לגרום נזק רב למוסד פרס ישראל בכלל ולמכון בפרט".
עוד נטען בתגובה כי העתירה הוגשה בשיהוי ניכר ולפיכך יש לדחותה. על הזכייה בפרס הודיעה שרת החינוך דאז פרופ' יולי תמיר ב-18.3.09. כעבור 10 ימים פנה הפורום המשפטי לשרה וטען כי מדובר בניגוד עניינים בשל מעורבות עו"ד לנגנטל בהליכי עבודת ועדת הפרס. עוד טוענת המדינה כי ב-6.4.09 פנה הפורום אל שר החינוך הנכנס, ח"כ גדעון סער, וחזר על טענותיו והוסיף חדשות, הנוגעות לטענת הפורום לחשש לניגוד עניינים לכאורה שבו נגועים חברי צוות השופטים. הפורום המשפטי טען כי ב-16.4.09 פנה ללשכת שר החינוך על-מנת לברר "מה עלה בגורל הפנייה" ונמסר להם כי היא לא התקבלה ולכן נשלחה בשנית.
לפיכך, "רק ביום 20.4.09 הוגשה העתירה לבית המשפט והעתק ממנה הומצא לפרקליטות בשעות הערב של אותו היום". משמעות אותו שיהוי היא כי "נותר שבוע ימים בלבד עד למועד חלוקת הפרסיים שעתיד להתקיים ביום העצמאות 29.4.09 ... מעל 1,400 הזמנות לטקס הודפסו ונשלחו ... שמו של המכון נמנה בין מקבלי הפרס המוזכרים בהזמנה ... החוברת המחולקת במהלך הטקס הענקת הפרס ( המכילה כ-150 עמודים) בה ישנה התייחסות מפורטת לכל אחד מן הזוכים נשלחה כבר לדפוס ועתידה להיות מוכנה בתחילת השבוע הבא".
עוד נטען בתגובת המדינה כי לנוכח הימים הספורים שנותרו עד לטקס עצמו וכאשר ההיערכות לטקס עומדת על סף סיום, "היה על הפורום המשפטי להקדים פנייתו לבית המשפט אף אם טרם התקבלה תשובת המדינה, לנוכח לוח הזמנים הקצר ביותר שנותר עד למועד הענקת הפרס".
