בעקבות התפשטות שפעת החזירים במקסיקו ובמדינות נוספות, הקימה הסוכנות היהודית מטה חירום מיוחד. מטה החירום עוקב אחר ההתפתחויות במשבר הבריאותי העולמי ונערך למתן מענה מיידי למאות שליחי ועובדי הסוכנות היהודית ברחבי העולם.
בראש המטה עומד סמנכ"ל הסוכנות היהודית - משה שיף.
המטה פועל בתיאום מלא עם משרד החוץ הישראלי ובהתייעצות עם רופאים ישראלים.
לאחר התייעצות עם אנשי מערכת הבריאות, משרד החוץ וגורמים מקצועיים נוספים, הוחלט בשלב זה במטה החירום כי שליחי הסוכנות היהודית ימשיכו למלא את משימותיהם בקהילות היהודיות.
ככלל, נקראו עובדי הסוכנות היהודית במקסיקו להישמע להוראות משרד הבריאות המקומי ולהימנע עד כמה שניתן מיציאה מבתיהם. עוד הוחלט במטה החירום להעמיד לרשות השליחים צוות רופאים בישראל שיענה על שאלות השליחים בכל נושא הקשור למחלה.