האפיפיור החל היום (ד', 13.5.09) את ביקורו ברשות הפלשתינית וחיזק את הפלשתינים כשאמר "זכותכם להקים מדינה פלשתינית ריבונית בשטחיכם".
בשעה 09:30 הגיע בנדיקטוס ה-16 לטקס קבלת פנים עם נשיא הרשות הפלשתינית, מחמוד עבאס (אבו-מאזן), ועם ראש הממשלה הפלשתינית, סלאם פיאד. משם הוא צפוי להגיע למיסה חגיגית בכיכר מאנגר.
במסגרת נאומו התייחס בנדיקטוס ה-16 גם לבעיית הפליטים הפלשתינים ואמר "לבי יוצא אל כל אותן משפחות שנשארו ללא בית". עוד אמר כי הוא משתתף בצער משפחות ההרוגים ממבצע 'עופרת יצוקה': "לאלו מכם האבלים על אובדן בני משפחותיכם בעימות, אני מציע חמלה עמוקה וזיכרון באמצעות תפילה".
האפיפיור ספג ביקורת ביומיים האחרונים על דברים שנשא בביקורו ביד ושם, שלטענת רבים לא היו חריפים מספיק ונאמרו בצורה כוללנית, ודובר הוותיקן נאלץ אמש להכחיש את עברו הנאצי של בנדיקטוס ה-16, נושא שהתעורר שוב לאור ביקורו. גם בירדן, יום קודם לכן, נמתחה על האפיפיור ביקורת על כך שלא בחר להתנצל פעם נוספת על דברים שנאמרו בגנות האיסלאם.
בין הביקורים המתוכננים לאפיפיור היום, גם ביקור במחנה הפליטים אל-עאידה שבבית לחם.
את הביקור יסיים בטקס פרידה שיתקיים בארמון הנשיאות שבבית לחם.
בעקבות ביקורו של האפיפיור בבית לחם ייחסמו לתנועה הרחובות חברון, יריחו, מעלה השומרון וחטיבת ירושלים שבבירה.
מחר יסיים האפיפיור את ביקורו בישראל וברשות הפלשתינית בנצרת במיסה גדולה.