באזור קריית גת, סמוך לדרך שש, כ-300 מטרים לפני לכפר מנחם, ניתקו שני קרונות אחוריים של רכבת מהפסים, אך לא התהפכו. נוסע אחד נפצע באורח קל-בינוני בראשו, נוסע אחר קל וכשלושים נוסעים נפגעי חרדה.
הרכבת, שהורכבה מחמישה קרונות, הייתה בדרכה מבאר שבע לתל אביב. אל המקום הגיעו צוותי חילוץ והצלה. נמסר כי האירוע נמצא בשליטה. מנכ"ל הרכבת וצוות מטעמו הגיעו לזירת התאונה.
נוסעים ברכבת אמרו כי רוב הנוסעים חשים בטוב. על-פי אחת העדויות, במשך 20 דקות היטלטלה הרכבת מצד לצד, היו רעשים ואבנים עפו אל הרכבת. הנוסעים החליפו מבטים, והעלו תהיות באשר לפשר האירוע. לפתע נשמע בום של נפילת הקרון ונוסחים פצחו בצעקות היסטריה. על הנוסעים נאסר לצאת מן הרכבת, והמזגנים כבו. כעבור דקות ארוכות חודשה פעילות המזגנים, ולנוסעים הורשה לצאת מן הרכבת. הם הלכו בשטח עד לכביש שש, משם אמורים לחלץ אותם. נאמר להם כי רכבת יצאה מלוד כדי לאסוף אותם.
הפסקת תנועת הרכבות בשל תיקון המסילה שנפגעה בתאונת שימוט קרונות הרכבת, הופסקה תנועת הרכבות בקו לוד-באר שבע עד יום שישי בבוקר. לא תתאפשר נסיעה ברכבת מ/אל תחנות: לוד, קריית גת, להבים-רהט, באר שבע צפון/אוניברסיטה, באר שבע מרכז, דימונה.
שר התחבורה ישראל כ"ץ הודיע כי יקים ועדת חקירה, שתעבוד במקביל לחקירה הפנימית של
רכבת ישראל. נהג הרכבת טען בחקירתו הראשונית כי נסע במהירות נמוכה (60-50 קמ"ש לערך). הוא האט את נסיעתו לקראת מפגש רכבות עם רכבת שבאה מכיוון צפון. לאחר שעבר את המסוט, נשמט החיבור בין הקרונות. הנהג ששמע את הרעש החריג עצר מיד את הרכבת. מנכ"ל הרכבת אמר כי אפשר שקפיצת הגלגל מהמסוט למסילה היא כנראה זו שגרמה לתאונה.
