מזכ"ל האו"ם באן קי מון אמר כי הוא מזועזע מהפעולה של ישראל.
יוון זימנה את שגריר ישראל באתונה, ודרשה "מידע מיידי" לגבי מצבם של אזרחים יוונים שהיו על גבי הספינות הסיוע בדרכן לעזה. בנוסף, בהודעה רשמית של הממשלה צבא יוון החליט להפסיק את כל התמרונים הצבאיים שנערכו בימים האחרונים עם חיל האוויר הישראלי.
שר החוץ השוודי, קארל בלידט, אמר לכלי התקשורת בשטוקהולם כי זה קריטי "לברר במהרה" מה קרה למשט הסיוע, אשר נשא 10,000 טונות של ציוד הומניטארי לעזה. בלידט הביע דאגה לגבי דיווחי התקשורת, בעיקר הטורקיים, לגבי הריגתם ופציעתם של עשרות רבות של פעילים על גבי הסיפון. "אנו מנסים לברר מה קרה", כך לדבריו של בלידט לרדיו השוודי. "זימנו את השגריר הישראלי כי לקבל מידע", והוסיף כי הם היו בקשר מתמיד עם האיחוד האירופי ושרת החוץ, קת'רין אשטון, כדי "לקבל תגובה ברורה במהלך היום, כדי שנוכל לברר מה בדיוק קרה".
חלק מהדברים שבלידט אמר היו כי הם ינסו לברר האם האירוע אכן קרה במים בינלאומיים, או שמא במים טריטוריאליים של ישראל. "זהו מצב חמור במיוחד, ותהיינה לו השלכות רציניות מאוד".
ממשלת ספרד הודיעה גם היא כי היא מזמנת את השגריר הישראלי לשיחות הבהרה, בעקבות פעילות צה"ל בלב ים. ספרד היא כיום הנשיאה התורנית של האיחוד האירופי.
