לאחר שבע שנים וחצי בתפקיד, הודיע הבוקר (יום ו', 25.6.10) מנכ"ל נ.ת.ע, ישי דותן, לדירקטוריון החברה על סיום תפקידו. ישי ביקש לסיים באופן מיידי את עבודתו בתכנון ובביצוע פרויקט הרכבת הקלה באופן מיידי, אך הודיע כי ישמח להעמיד לרשות החברה את הניסיון והידע הרב שצבר ככל שיתבקש.
במכתב ההתפטרות כתב דותן כי הוא מאמין שהצליח להביא את החברה להישגים רבים. אך הדבר היה כרוך במאמץ אישי כבד וממושך לאורך השנים. "בימים אלה יוצאת החברה לדרך חדשה של מימוש הקו האדום ולא יתאפשר לי ללוות את הפרויקט עד סופו".
"אני מאמין", כתב דותן, "שראוי שהדרך החדשה של הרכבת הקלה תהיה בידי מנהל חדש אשר יוכל לקחת על עצמו את המשימה ולהביאה עד נקודת הסיום. מנהל חדש יוכל לבחור את הדרך בה ירצה לקדם את החברה ולממש את משימותיה".
ישי דותן הודה לחברי הדירקטוריון ולמנהלי ועובדי נ.ת.ע על העבודה המשותפת.
מיכאל רצון, יו"ר נ.ת.ע הביע את צער על החלטתו של ישי והודה לו על תקופת כהונתו. רצון אמר כי מימוש חזון הרכבת הקלה לא יכול היה להתבצע בלי ישי דותן ."ישי הוא מנהל מסור ובעל ידע רב ואני בטוח כי אנו עוד נזדקק לניסיונו ולידע הרב שצבר גם בעתיד".