לא לחינם חיבבו בשס מאז ומתמיד את משרד הפנים - עוד מתקופת יצחק פרץ ו
אריה דרעי. במשרד הזה יכול שר עם אג'נדה ברורה לקבל החלטות חשובות שמשפיעות על כל אזרחי המדינה.
אחת מההחלטות של ישי, שעוררה סערה באחרונה, הייתה לסגור בשבת את האתרים של משרדי ה
ממשלה שנמצאים שבשליטת ש"ס - כמו אתר רשות האוכלוסין במשרד הפנים, משרד הדתות ופורטל אישי במשרד הפנים. "יום שבת נועד למנוחה", מנמק ישי. "זו לא כפייה. אני לא מתערב היכן האזרח גולש. במדינה יהודית שבת קודש היא חשובה ורוב העם מכבד את זה, להוציא כמה קיצונים".
נושא נוסף שנמצא תחת אחריותו של ישי הוא קביעת שעון החורף ושעון הקיץ. הכנסת אומנם חוקקה לפני חמש שנים את חוק שעון הקיץ וקבעה את מועדיו, אך השנה הדיון הציבורי בעניין עלה שוב לטונים גבוהים. לא כולם אהבו את העובדה שהמדינה עברה משעון קיץ לשעון חורף בתחילת ספטמבר - כשבאירופה עוברים לשעון החורף בסוף אוקטובר.
ישי אינו מתכוון בשלב זה לשנות את מועדי השעון. "אני אוהב שעון קיץ ארוך", הוא אומר. "מועדי שעון הקיץ נקבעו על-ידי ועדה מקצועית ועוגנו בחקיקה על-ידי הכנסת. מאחר שהשנה היא שנה מעורבת, קרה ששעון החורף נקבע מוקדם יחסית. פעם בשלוש שנים שעון החורף מגיע בספטמבר. לפני שתוקפים כדאי שיקראו את חוות הדעת של המומחים בקביעת השעון".
הסערות שחולל ישי עם שעון הקיץ וסגירת האתרים בשבת היו כאין וכאפס לעומת הזעם הציבורי שהופנה כלפיו בגין התבטאויות שלו בסוגיית העובדים הזרים. "מאות אלפי
עובדים זרים יביאו עמם מחלות צהבת, שחפת, חצבת, איידס וסמים", אמר ישי בתקשורת - והרוחות סערו.
כיום מסביר ישי כי לא התכוון לעובדים הזרים, אלא לפליטים: "עיוותו את דברי. יש עניין לתקוף שר דתי. לא אמרתי שהם מביאים מחלות אלא שבסודן ובאריתריאה - מהן באים המסתננים - אין מערכות בריאות מפותחות. הם עוברים דרך קשה ומגיעים לעתים עם מצב בריאותי קשה. כיום מגיעים לישראל כ-800 מסתננים בשבוע. שלשום הגיעו 170 מסתננים. פעם הם היו באים בלי ילדים. כיום הם באים עם ילדים בתקווה לקבל אזרחות".
ישי מציע "לנקוט יד קשה נגד המסתננים. לא להמתין עד להשגת תוצאות למכרז להקמת
גדר הפרדה בדרום אלא לחלק את השטח בין כמה חברות שיקימו גדר. ישראל צריכה להציב אוגדה אנושית ולהעמיד חיילים שיפקחו לבל יכנסו מסתננים. צריך גם לבנות מתקני מעצר שבהם יאחסנו את המסתננים".
מדיניות היד קשה של ישי באה לידי ביטוי גם בסוגיית גירוש ילדי העובדים הזרים. למרות המחאות הציבוריות וההפגנות, ישי נחוש כי יש לגרש את הילדים והוריהם. "העובדים הזרים מביאים ילדים שהופכים למגן אנושי או לפוליסת ביטוח", אומר ישי. "אנו צריכים להודיע להם שמי שנכנס בניגוד לחוק - צריך לחזור לארצו. ככה נוהגים בכל מדינה מתוקנת בעולם. כיום ישנם כ-20 אלף ילדים השוהים בישראל שלא כחוק. כל הילדים האלה ימתינו לקבלת אזרחות ויתבססו פה, וכך המספר עלול להגיע ל-100 אלף איש. כל מי שיוצא נגד זה נוהג בצביעות".