באמצע יוני 2010 העבירה עליזה כהן, יועצת שר החקלאות לשעבר
שלום שמחון, מכתב פנימי לבכירי משרד החקלאות. על-פי המכתב, הודלף לתקשורת (לעיתון "מקור ראשון") מידע מאגף הכספים, שנועד להציג את שמחון באופן שלילי. כהן הודיעה שבכוונתה לפנות למשטרה כדי לאתר את המדליפים.
בסוף יוני הפיץ ישי מכתב לעובדי המשרד, והתריע על פרסום נתונים בתקשורת. המנכ"ל פירט את העבירות הקשורות בפרסומים כאלה על-פי התקשי"ר, חוק העונשין וחוק הגנת הפרטיות. במכתבו הודיע שההנהלה תתשאל את עובדי אגף הכספים כדי לאתר את מקור ההדלפות בעניין עלויות ועדת זיילר.
בין משרד החקלאות לשב"כ מתקיימים קשרים "ביטחוניים" בשני עניינים בלבד: אבטחת השר - שבעניינה אין עילה למפגש מיוחד שנמשך כמה שעות - והטיפול בחומרים חקלאיים שונים, ובהם דשנים, שעלולים לשמש להכנת חומרי נפץ. סוגיה זו מטופלת במסלולים קבועים זה שנים רבות. לפיכך מתעוררת השאלה, האם במסגרת תפקידיו של שב"כ מצוי ייעוץ למשרדי הממשלה בענייני הדלפות ואבטחת מידע בנושאים לא ביטחוניים.
ח"כ
אבי דיכטר (קדימה), לשעבר ראש שב"כ, סירב להתייחס לשאלות "
גלובס".
יעקב פרי, יו"ר בנק
מזרחי טפחות, ששימש אף הוא ראש שב"כ, השיב: "בנושאים לא ביטחוניים, התשובה היא לא". ח"כ
ישראל חסון (קדימה), שהיה סגן ראש שב"כ, אמר כי "ברגע שהמידע מסווג - השירות הוא הגורם המקצועי שמנחה את משרדי הממשלה כיצד לאבטח את המידע".
שב"כ מסר: "שירות הביטחון הכללי, באמצעות הרשות הלאומית לאבטחת מידע, מופקד מכוח חוק על הנחיה מקצועית של הגופים המונחים בתחום אבטחת תשתיות מחשב חיוניות, מפני איומי טרור וחבלה בתחום אבטחת מידע מסווג ואיומי ריגול וחשיפה. הדלפות מידע שאין בהן סיכון לביטחון אינן בתחום אחריותו של שירות הביטחון הכללי - והוא אינו עוסק בהן".
שב"כ נשאל, האם הדיונים עם בכירי משרד החקלאות נגעו לנושאים הנוגעים לביטחון, איומי טרור וחבלה, אבטחת מידע מסווג, איומי ריגול וחשיפה - או, כפי שעולה ממידע שהגיע ל"גלובס", לנושאי הדלפות מידע ממשרד החקלאות לתקשורת בעניינים שאינם ביטחוניים, ובדרך למנוע אותן.
שב"כ מסר בתגובה כי "אנשי היחידה לאבטחת מידע נפגשו עם מנכ"ל משרד החקלאות ובכירים במשרד, בתוקף תפקידיהם המפורטים בחוק, בדגש על נושא אבטחת המידע במשרד. הדלפות מידע שאין בהן סיכון לביטחון אינן בתחום אחריותו של השירות, והשירות אינו עוסק בהן. כך גם במסגרת הפגישה הנדונה".
ממשרד החקלאות נמסר בתגובה. "הנתונים שבידיכם אינם נכונים כלל. אומנם נערכה פגישת היכרות בין הנהלת המשרד לבין גורמים בשב"כ, אך היא נערכה במסגרת יחסי העבודה בין שני הגופים, ונדונו בה נושאים ביטחוניים בלבד. הפגישה לא עסקה בנושאים פנים-משרדיים, או בהדלפות לתקשורת".