אהוד אולמרט אמר בעדותו במשטרה בפרשת רשות המיסים, כי
שולה זקן לא הייתה רשאית למסור לאיש פרט כלשהו מעבודתה בלשכתו כשר האוצר. כך גילה (יום א', 18.12.11) התובע במשפטה של זקן, יוחאי בן-שמואל, בחקירתה הנגדית של זקן. זאת, בעוד זקן טענה שידעה מה אינה רשאית לספר כדי שלא לפגוע באולמרט. זקן השיבה: "אם עשיתי משהו לא נכון, אז טעיתי. אני יודעת בביטחון שלא עשיתי שום דבר לא בסדר בעניין שעליו אני עומדת לדין".
בן-שמואל טען, כי אולמרט הזהיר את זקן לפחות פעמיים שלא לפעול בנושאים של מקורבים אליה כאשר התמנה לממלא-מקום ראש הממשלה. השופט
חיים לי-רן פסל את שאלתו של בן-שמואל על הסיבה לאזהרה זו. זקן אמרה, כי אולמרט הסביר לה שבמשרד רה"מ לא יוכלו להמשיך לעזור לגורמים שונים כפי שעשו בעיריית ירושלים ובמשרדי האוצר והתמ"ת. לדבריה, היא לא חשבה שכאשר קישרה בין אחיה,
יורם קארשי, לבין
אלפרד אקירוב,
לב לבייב ו
מוטי זיסר, היא עושה את הדברים אותם אסר עליה אולמרט. בחקירתה במשטרה, לעומת זאת, אמרה זקן שאולמרט היה כועס עליה אם היה יודע שעשתה זאת. בתשובה אמרה זקן, כי אולמרט היה כועס על כך שהיא מקדישה לכך מזמנה.
זקן שבה וסיפרה, כיצד מסרה לאולמרט - כאשר היה שר הבריאות - מעטפה שביקש ממנה קארשי למסור לו. לדבריה, ברגע בו מסרה אותה לאולמרט וראתה את מבע עיניו, הבינה ששגתה בכך. מדבריו של בן-שמואל עלה, כי המעטפה עסקה במינויו של שמואל מועלם למנכ"ל קופת חולים מאוחדת (תפקיד ממנו הודח בעקבות הדוח החמור של
מבקר המדינה).
"זה מאוד ריגש אותי" בן-שמואל טען שזקן סיפרה מראש לקארשי על כוונתה להיפגש עם שלושת המועמדים לניהול רשות המיסים. זקן הכחישה זאת, אך בן-שמואל אמר שהדבר אושר הן בידי קארשי והן בידי
ג'קי מצא, ואף בידי זקן עצמה בעימות במשטרה עם מצא. זקן השיבה, כי ייתכן שאמרה לקארשי שיש כוונה כללית לזמן את המועמדים, אך לא מסרה לו את המועד המדויק.
קארשי העיד, כי ידע על המועד המדויק בו ייפגשו זקן ועוזרו הבכיר של אולמרט, עובד יחזקאל, עם מצא. זקן הכחישה בתוקף את האפשרות שמסרה לו מידע זה, והעלתה את האפשרות ששמע על כך מיחזקאל. בן-שמואל ציטט מעדותו של קארשי, לפיה מידע זה הגיע אליו מזקן. לדברי זקן, היא סיפרה לאנשים רבים על הליך המינוי של מנהל הרשות, שכן "זה מאוד ריגש אותי", אך לא מסרה לקארשי פרטים מדויקים, אם כי "הוא ידע שאני עושה דברים מהרגע להרגע".
זקן הוסיפה, בהתייחסה לביקורתה הקשה על קארשי בחקירתה הראשית: "התגובה שלי על ההתנהגות של יורם עשתה הרבה מאוד במשפחה שלי, במיוחד לאמא שלי, אבל אני לא חוזרת בי". היא שבה ואמרה, כי כאשר העיד קארשי - נמנעה, רק מפאת כבוד בית המשפט, "להחטיף לו סטירה". לדברי זקן, קארשי היה יכול לשאול אותה ולבקשה ממנה כל דבר, אך לא תמיד השיבה לו או נענתה לו.
"תפסיק לצעוק עלי!" בן-שמואל הציג בפני זקן תמליל שיחה בינה לבין קארשי, בו היא מספרת לו כיצד יישבה מחלוקת בין מי שהיה ראש מטהו של אולמרט,
יורם טורבוביץ, לבין השר לשעבר
צחי הנגבי. זקן אמרה, כי סיפרה זאת לקארשי מתוך תחושת גאווה, על כך שהצליחה להסדיר בעיה שאדם בכיר ממנה ובעל תואר דוקטור (טורבוביץ) לא הצליח להסדיר.
החקירה הנגדית הייתה רצופה בעימותים בין בן-שמואל לבין סניגורה של זקן, מיכה פטמן. לי-רן דרש מן הצדדים להפסיק את התוקפנות, אך העימותים נמשכו. "תפסיק לצעוק עלי! גם אני יודע להרים את הקול. זה די נמאס לי!", אמר פטמן באחת ההזדמנויות. זקן מצידה העירה לבן-שמואל, כי "להבדיל מהחוקר ששיקר אותי, אני רוצה להניח שנשארה בי קצת תמימות ושאתה אומר לי את האמת" בצטטו ממסמכים ועדויות. לי-רן פסל שאלות של בן-שמואל שהתבססו על אמירות וראיות שהוצגו במשפטם של אולמרט וזקן בפרשות טלנסקי וראשונטורס.
