מבקר המדינה קורא להכניס שינויים בשיטה, שלפיה מעבירה המדינה מדי שנה 27 מיליארד שקל לארבע קופות החולים. הכספים מחולקים לפי מדד משולב, המביא בחשבון מרכיבים שונים. המבקר מציע להכניס בו את השינויים הבאים:
- מתן תמריצים לקופות שיעמדו ביעדים הציבוריים והרפואיים, כפי שקבע משרד הבריאות;
- תמריצים, שיעודדו תחרות מקיפה ואמיתית בין הקופות, לא רק על קבלת מבוטחים צעירים ובריאים, כפי שנהוג כיום, אלא על כלל תושבי המדינה;
- הכנסת מרכיב של "מצב הבריאות", שיבדוק מתן סיוע מוגדל לקופות לטיפול בחולים במחלות כגון סרטן וסוכרת;
- הקמת מנגנון קבוע, שיבדוק מדי פעם את מרכיבי המדד ויכניס בהם שינויים על-פי הצורך.
בנוסף, מתייחס מבקר המדינה גם להקצאה נוספת של 1.5 מיליארד שקל בשנה, שנועדה לממן לקופות טיפול בכ-9,000 חולים ב-5 מחלות קשות. המבקר מציע לבדוק מחדש את רשימת המחלות ולעדכן אותה, ואולי לבטל כליל רשימה זו, ולסייע לקופות בדרכים אחרות לטפל בחולים אלו.
דוח הביקורת מזכיר נתון שכבר פורסם בעבר, שלפיו מקצה המדינה מדי שנה 39 מיליארד שקל לסיוע לקופות החולים. לא כל סעיפי ההקצאה מפורטים בדוח המבקר (ראו לעיל הקובץ המצורף). הוא מזכיר הקצאה של 530 מיליון שקל לייצוב מצבן הכלכלי של הקופות.
