צה"ל נערך בתקופה האחרונה ברמת הגולן למניעת פריצה אפשרית של גדר הגבול בין ישראל לסוריה על-ידי פליטים סורים שיימלטו מאימת הדמים של המרד בנשיא בשאר אל אסד.
דובר צה"ל אישר כי כלים הנדסיים כבדים של צה"ל פועלים לחפירת תעלות ולבניית מכשולים נוספים אשר נועדו למנוע את ההסתננות.
גורמי ביטחון ציינו כי החשש הוא מפני הימלטות של עשרות אלפי פליטים ואף יותר מזה לאחר ששלטונו של אסד ייפול. על-פי אחד התרחישים עשויים רבים מבני העדה העלאווית, עדתו של אסד שנמצאת במיעוט בסוריה, להימלט לכל עבר לאחר שהמורדים יתפסו את השלטון. במסגרת הימלטות זו ינסו רבים לחצות את גדר הגבול עם ישראל ולעבור לשטחה.
מאז מאי 2011, כאשר המוני פלשתינים מסוריה התנפלו על גדר הגבול שבין ישראל לסוריה סמוך למג'דל שמס, תגברה מערכת הביטחון את אמצעי ההגנה מפני הסתננויות בגזרה. באותה תקרית הצליחו עשרות סורים לחצות את גדר הגבול. חלקם אף המשיכו והגיעו לתוך עומק מדינת ישראל.
החשש הגדול של ישראל הוא מפני הסתננות גורמי טרור עוינים במסווה של פליטים המבקשים מקלט
הומניטרי.
לאחרונה הזהיר ראש אגף המודיעין של צה"ל, אלוף אביב כוכבי, כי בעקבות המשבר בסוריה עלולה רמת הגולן להפוך לזירת טרור. לדבריו, "כתוצאה מהתבססות הג'יהאד העולמי בסוריה מרחב הגולן עלול להפוך לזירת פעילות נגד ישראל, בדומה לסיני".