רשויות המס החלו בינואר 2012 בביצוע בדיקה לגבי כספים ששילמה כנסיית קסטודיה טרה סנטה ירושלים לבעלי מקצועות חופשיים. הבדיקה נערכת מחמת חשש שהועלה, לפיו התבצעו תשלומים פיקטיביים באמצעות בנקים זרים.
הבדיקה מתבצעת לגבי שנות המס 2010-2007. במסגרת זו, נדרשה הנהלת הכנסייה להמציא לרשויות המס: רשימת נותני שירותים, בהם עורכי דין, רואי חשבון, מתווכים, שמאים וסוחרי רכב, אשר קיבלו בשנים האמורות תשלומי שכר טירחה בהמחאות משוכות מבנקים זרים.
הדרישה כוללת את פרטיו של נותן השירות, לרבות מספר תעודת זהות, סכומי הכסף שקיבל ובגין איזה שירות בדיוק. מטרת רשויות המס, כאמור, היא לבצע ביקורת, שבסופה ייקבע האם יש די ראיות המעידות על תשלומים פיקטיביים לגורמים שונים, והאם מקבלי התשלומים דיווחו עליהם כחוק.