בית המשפט למשפחה הוא המוסמך להתיר נישואים חד-מיניים, לנוכח סירובו של בית הדין הרבני לעשות זאת. כך קובע (21.11.12) שופט בית המשפט למשפחה בתל אביב, יחזקאל אהרון.
שני גברים שנישאו בקנדה ביקשו להתיר בישראל את קשר הנישואין ביניהם. בית הדין הרבני סירב לדון בעניינם, מאחר שההלכה אינה מכירה בנישואין חד-מיניים. השניים ביקשו מבית המשפט למשפחה לעשות זאת, משרד הפנים טען שהסמכות נתונה רק לבית הדין הרבני, אך אליהו קיבל את עמדתם של המבקשים.
אליהו מסתמך על פסק דינו של שופט בית המשפט המחוזי בירושלים,
משה דרורי (שהוא שומר מצוות), ולפיו בכל מקרה בו אין סמכות לבית הדין הדתי - היא מצויה בידי בית המשפט למשפחה. לדבריו, "העובדה, כי בית הדין הרבני לא פתח את התיק לתובעים מיד עם הגשתו וביקש שהות לבדוק את העניין מדברת בעד עצמה... לשיטתי כבר בהשתהותו של בית הדין לפתוח התיק ולקבל אגרה, הפקיע בית הדין את סמכותו לדון בתביעה".
אליהו מוסיף: "עמדת הנתבע, כי על התובעים להגיש תביעתם לבית הדין הרבני,כאשר עמדת הדין הדתי לגבי תוקפם של נישואי התובעים ידועה וברורה לכל, הינה בלתי סבירה לחלוטין". לדבריו, העובדה שבתי הדין האזרחיים - ובהם בית המשפט למשפחה - דנו רבות בהיבטים שונים של נישואין חד-מיניים, מלמדת שהם הפורום הטבעי לדון גם בהתרתם של נישואין כאלו.
לבסוף אומר אליהו, כי מאחר שבג"ץ כבר הורה לרשום נישואין חד-מיניים - חייבת להיות לבית המשפט סמכות גם להתיר אותם, ולא לאלץ את בני הזוג להישאר כבולים זה לזה בניגוד לרצונם. לאור כל זאת הורה אליהו על הפסקת הנישואין בין השניים. את המבקשים ייצגה עו"ד יהודית מייזלס, ואת משרד הפנים - עו"ד יהודית אריאב-פוקס.