יעקב נאמן לא יהיה שר המשפטים בממשלה הבאה - את זה הוא הודיע מזמן, למעשה כבר בתחילת הקדנציה. אולי בגלל זה רק עכשיו הוא נזכר להביע תמיכה, שאינה מחייבת אותו לפעולה, ביצירת הפרדה בין מערך החקירות לבין מערך התביעות במשטרה. כיום שני הגופים עובדים יחדיו, וכך נוצר מצב בו בנוסף לאנומליה הכרוכה בכך שהגוף החוקר הוא גם הגוף המאשים - הרי שבתוך אותו גוף עצמו אין הפרדה של ממש בין שתי הפונקציות.
במכתב ששיגר (24.12.12) לעו"ד פיני פישלר, המנהל מאבק ממושך בנושא זה, כתב נאמן: "בעבר נעשו מספר פעולות על-מנת ליצור הפרדה בין מערך החקירות במשטרה לבין מערך התביעות המשטרתיות. יחד עם זאת, לדעתי יש לבחון בחיוב ביצוע פעולות נוספות בהקשר זה, כגון הצבת ממונה נפרד לכל אחד מן המערכים. אבקשך לשוב ולהעלות נושא זה בפני שר המשפטים והשר לביטחון פנים שיכהנו בממשלה הבאה".