הפרוטוקולים של ישיבת הממשלה שדנה במסקנות ועדת כהאן נחשפים לראשונה, שלושים שנה לאחר קיום הישיבה. מן הפרוטוקולים עולה כי שר הביטחון דאז,
אריאל שרון, הזהיר את ראש הממשלה דאז, מנחם בגין, מפני קבלת המסקנות שכללו את הדחתו מפני שאז יוטבע אות קין במצחם של חברי הממשלה "לדורי דורות", כלשונו.
הישיבה הסוערת שהתקיימה במקביל להפגנת
שלום עכשיו שהדיה נשמעו היטב בחדר הישיבות ואשר במהלכה נרצח אמיל גרינצוויג בידי יונה אברושמי, התחילה בהיעדר שר הביטחון שהתעכב בשל הפגנה של אנשי שלום עכשיו סמוך לביתו בחוות שקמים.
עם הגעתו אל חדר הישיבות תקף שרון את הקוראים להדיחו. "איני עסוק בלהיטות בהסקת מסקנות אישיות וחיפוש קורבנות וכפרות. הדוח כשלעצמו יש בו חלקים שאפשר בהחלט לקבל אותם ומן הראוי לקבל אותם, אבל מצאתי בו חלקים שלדעתי אין לקבל אותם. מדובר בנושא שהוא הרחק מעבר לשאלה האישית שבה מרבים לדוש אם שרון ילך או לא ילך", אמר. "אם נקבל את הדוח יבואו שוחרי רעתנו ועלולים לטעון שמה שבוצע במחנות זו השמדת עם. מה גם שהוועדה לא היססה למתוח קו משווה בין ישראל ובין שותפים עקיפים בביצוע פוגרומים שהשתתפו בעשיית מעשי זוועה בעם ישראל ואני באופן אישי דוחה בשאט נפש אפילו רמז של האשמה כזו. ישנם חלקים שלפי דעתי אסור לקבל אותם אם איננו רוצים שהנטל הזה, אות קין, זה יהיה טבוע במצחנו לדורי דורות", דברי שרון. בסרקזם האופייני לו ציין כי הוא מוכן לצאת למלחמה ולעזוב את התפקיד בעוד שאר השרים יכולים להמשיך וליהנות מבורקס התרד ומבורקס הגבינה על שולחן הממשלה.
עוד הוסיף כי הדבר החמור ביותר שייחסה לו ועדת כהאן הוא האישור שכביכול נתן להכנסת הפלנגות למחנות הפליטים סברה ושתילה על-מנת לחסוך בחייהם של חיילי צה"ל וכי הוא כופר בטיעון שמדובר בשיקול פסול.
"אדוני ראש הממשלה, זהו הדבר הכי חמור שמייחסים לי. לא מייחסים לי שחברתי לפלנגות או משהו כזה, לא שהרגתי במו ידי. לבוא ולומר שהשיקול של חיי החיילים שלנו הוא כבר לא שיקול, אז אני מוכן לעמוד בפני כל אחד מכם לפני שתערפו את ראשי, להביט בפניו של כל אחד מכם ולחזור ולומר שכאשר על כף המאזניים חיים של חיילים שלנו, לדעתי זה חייב להיות שיקול עיקרי".
בין שרון לבגין הייתה מתיחות גדולה באותה ישיבה והיא באה לידי ביטוי בחילופי דברים ביניהם שבשיאם ניסה שרון לומר שאינו מאשים את ראש הממשלה באחריות ועל כך השיב לו בגין: "אבל זו הייתה הכוונה".
בשלב מסוים של הישיבה נכנס מזכירו הצבאי של בגין, סגן אלוף עזריאל נבו, ומדווח לו על התפוצצות מטען בקרב מפגיני שלום עכשיו. אחד מן הפצועים היה אברום בורג, בנו של השר יוסף בורג שהשתתף בישיבה ולימים חבר כנסת ויו"ר הכנסת.
"התפוצץ מטען בין המפגינים, כנראה יש כמה פצועים, בודקים זאת", אמר. לאחר שנשלח לבדוק מה קרה חזר ובפיו הדיווח הבא: היה מטען או נזרק רימון", אמר. לאחר שנודע כי אמיל גרינצוויג נהרג קרא בגין: "ישנו הרוג, יהודי הרוג!! עזריאל, איך מניחים שזה קרה? מחנה אחד זרק על השני?" על כך ענה נבו: "מניחים שכך, אבל אין שום הוכחות. מישהו מעריך שזה היה רימון, שנזרק. מחפשים עתה רסיסים".
