בדיון בוועדה לענייני ביקורת המדינה בנושא חריגות השכר באוניברסיטת בר-אילן, ציין (יום ג', 28.5.13) הממונה על השכר קובי אמסלם, כי פסק-דין של בית הדין הארצי לעבודה מלפני כשנה קובע כי סמכות הממונה על השכר חלה על האוניברסיטאות.
"פסק הדין מחייב את האוניברסיטאות לקבל את סמכות הממונה על השכר. אמשיך לפעול לסיום ההליכים הנדרשים על-מנת שהאוניברסיטאות יכירו בסמכות הממונה על השכר ויפעלו בהתאם. לבקשת יו"ר הוועדה לענייני ביקורת המדינה, נציע תיקוני חקיקה אשר נועדו להתמודד עם כשלים פנימיים בגופים הנתמכים והמתוקצבים בכל הנוגע לפיקוח על הוצאות השכר וקבלת סמכות הממונה על השכר", אמר אמסלם.
הממונה על השכר הודיע כי המעקב והבקרה אחר השכר באוניברסיטאות יימשך ויימסר דיווח ליו"ר הוועדה לענייני ביקורת המדינה על התקדמות ההליכים בעניין.
בנוגע למנכ"ל האוניברסיטה לשעבר, חיים גליק, אמר הממונה כי "גליק ישיב כספים שקיבל בגין החזר כפול של הוצאות רכב ובהמשך אף יידרש להשיב כספים שקיבל בגין קבלת שכר חורג, בהתאם למה שייקבע ביחס ליתר הבכירים באוניברסיטאות".
יו"ר הוועדה לביקורת המדינה,
אמנון כהן, אמר כי "לא ייתכן שהגופים האלה כופרים בסמכות הממונה על השכר. איך ייתכן שאנחנו נמצאים בתקופת קיצוצים וכאן יש בכירים שמקבלים העלאות שכר מכספי הציבור ללא אישור? זו שערורייה!". יו"ר הוועדה הדגיש כי "לא מספיק שיתוקנו הליקויים שהועלו בדוח
מבקר המדינה בעניין חריגות השכר. צריך גם לדאוג להשבת הכספים".