הרב הראשי לישראל, הרב
יונה מצגר, שוחרר (יום ה', 20.6.13) בידי חוקרי יחידת להב 433 עם תום חקירתו, שנמשכה כעשר שעות. הוא שולח בערבות ובתנאים מגבילים למעצר בית של חמישה ימים, ונאסר עליו להגיע ללשכתו 15 ימים נוספים. כמו-כן, נאסר עליו לצאת לחו"ל וליצור קשר עם המעורבים בפרשה. הרב מצגר נחקר בחשד לעבירות של שוחד, מרמה ו
הלבנת הון.
במקביל הוארך מעצרם של שלושת החשודים האחרים בפרשה. חיים ניסן איזנשטט, נהגו ועוזרו האישי של הרב מצגר, חשוד בעבירות של לקיחת שוחד, קבלת דבר במרמה, מרמה והפרת אמונים והלבנת הון. מעצרו הוארך בשבוע לאחר שסגן נשיאת בית משפט השלום בראשון לציון,
ירון לוי, קבע שהוא החשוד המרכזי מבין השלושה.
הרב ניסן ציוני, מנהל בית מדרש והכשרת רבנים ודיינים בתל אביב, רב כולל "שירת דבורה" בתל אביב ומנהל עמותת "צדקה ומשפט", חשוד בעבירות על איסור הלבנת הון ומתן שוחד. מעצרו הוארך בשישה ימים.
שמחה קרקובסקי, מנהל עמותת "בית התבשיל" בבני ברק, חשוד בעבירות על איסור הלבנת הון ומתן שוחד. מעצרו הוארך בחמישה ימים.
לוי אומר בהחלטתו: "מחומר החקירה מתקבלת תמונה של העברת כספים אסורה, בהיקף כספי ניכר, מהלך תקופה ממושכת, במסגרת מספר אירועים. לכל אחד מהחשודים תפקיד משמעותי בשרשרת העברת הכספים. עם זאת, חלקו של איזנשטט המשמעותי ביותר מבין החשודים.
"מחומר החקירה עולה חשד סביר, המצביע על תפקידו המרכזי של איזנשטט ומעורבותו העמוקה במסכת קבלת הכספים האסורה, שיש בה כדי לקשור ברמה הנדרשת, בשלב זה, ואף מעבר לכך, את איזנשטט למעשים המיוחסים לו. בעניינם של קרקובסקי וציוני קיימת תשתית ראייתית, שיש בה כדי לבסס חשד סביר מוצק למעשים המיוחסים להם, אם כי היקף מעורבותם אינו רחב כשל איזנשטט".
הסניגורים טענו לאיפה ואיפה, לנוכח העובדה שהרב מצגר לא נעצר. נציג המשטרה רמז באחד הדיונים, כי השיקול שמאחורי ההחלטה הוא "כבודה של הרבנות". לוי הגיב על טענת הסניגורים באומרו: "בשים לב להיקף למעשים המיוחסים לחשודים, עומק מעורבותם ועוצמת התשתית הראייתית נגדם - ובמיוחד לאור הצהרת המשטרה כי תגבש עמדתה ביחס למעורבים אחרים לאחר סיום חקירתם שנמשכה אף במהלך הדיון - לא מצאתי שיש בהימנעות זו כדי להצדיק, בשלב זה, שחרור החשודים".
לוי סיכם: "חלק מפעולות החקירה מצדיקות מעצר החשודים מאחורי סורג ובריח. בנוסף בשים לב למהות המעשים, מיהות המעורבים, ריבוי המעורבים, החשד המבוסס כי הייתה התארגנות מראש לביצוען, קיים חשש טבוע לאפשרות של שיבוש הליכים. בשים לב לדפוס הפעולה של החשודים, כפי שעולה מחומר החקירה, החשש לשיבוש הליכים בעניינם מבוסס".
התנועה לאיכות השלטון ותנועת אומ"ץ דורשות להשעות את הרב מצגר מתפקידו.