רמי אפרתי התמנה (יום א', 23.6.13) לנשיא ארגון המתנדבים ליונס ישראל, המהווה חלק מארגון ליונס הבינלאומי. בליונס ישראל כ-1,000 מתנדבים, החברים ב-33 מועדונים ברחבי המדינה. ארגון ליונס הבינלאומי מונה כ-1,300,000 חברים.
במקביל להתנדבותו בארגון ליונס, מכהן רמי אפרתי כראש אגף בכיר במטה הסייבר הלאומי במשרד ראש הממשלה. במסגרת תפקידו אחראי אפרתי על המגזר האזרחי. בעבר שירת בתפקידים בכירים ביחידה 8200 ובאגף המודיעין בצה"ל. לאחר שחרורו מצה"ל בדרגת אל"מ, כיהן אפרתי בשורה של תפקידים בכירים במגזר העסקי. בין השאר כיהן כסגן נשיא לשיווק, מכירות ופיתוח עסקי בחברת נייס; מנכ"ל חברת בריינסטורם, העוסקת במחקר על בסיס תאי גזע של מחלות ניווניות, ובעיקר מחלת ה-ALS ועוד.
מועדוני ליונס ישראל מיישמים את מטרות הארגון בהתאם לצרכי הקהילה בה הם פועלים: עזרה לעיוורים וללקויי ראייה, תמיכה במועדוניות לגיל הרך ולנערים בסיכון, חגיגת בר-מצווה לילדי משפחות מעוטות יכולת, חלוקת מזון לנזקקים, רכישת מתקנים וציוד רפואי למחלקות בבתי חולים, מלגות לתלמידים וסטודנטים מיעוטי יכולת, פעילות לרווחת הקהילה בבתי חולים, התרמות דם למד"א, השאלת ציוד רפואי לנזקקים ועוד.