משרד המשפטים מבקש להאריך בשנתיים את תוקפה של הוראת השעה, מכוחה מגישה המשטרה כ-80% מכלל כתבי האישום המוגשים בישראל. זאת, למרות שבכירי המשרד הודו בשנה האחרונה שמדובר במצב בעייתי.
שר המשפטים לשעבר,
יעקב נאמן, ומנכ"ל משרדו, ד"ר
גיא רוטקופף, כתבו לעו"ד פיני פישלר, כי הם מכירים בבעייתיות הקיימת במצב בו אותו גוף גם חוקר וגם מגיש כתבי אישום. אולם, אמרו, שינוי המצב מצריך חשיבה מרובה והיערכות מתאימה. ההערכה היא, שהפרקליטות אינה מעוניינת לעסוק בתיקים אלו, שהם עבירות קלות יחסית, ומעדיפה שעומס זה יפול בחלקה של המשטרה.
בהוראת השעה משנת 2010 נקבע, כי חומר חקירה בעבירות מסוג פשע מועבר לטיפול פרקליט, ואילו חומר חקירה בעבירות מסוג עוון וחטא מועבר לטיפול תובע משטרתי. תיקים מורכבים, רגישים או בעלי חומרה מיוחדת טופלו על-ידי הפרקליטות, ואילו תיקים בעבירות חמורות פחות, אשר אינם מורכבים מבחינה ראייתית, בהם נדרש בירור מהיר ואשר התביעה המשטרתית התמקצעה בטיפול בהם - טופלו על-ידי התביעה המשטרתית.
לדברי משרד המשפטים, "הניסיון ביישום הוראת השעה העלה כי ככלל, ההסדר משביע רצון, ומחלק חלוקה ראויה את התיקים בין הפרקליטות לתביעה המשטרתית, ותורם לאחידות בין המחוזות השונים. כן עלה מהדיווחים השנתיים כי לא נעשה שימוש בהסמכות שוטרים על-מנת לעקוף את הוראות ההסדר. עם זאת, על-מנת להמשיך ולבחון את ההסדר המוצע ועל-מנת לאפשר סיפק בידי הגורמים המתאימים לבחון שוב את איחוד התביעה המשטרתית עם הפרקליטות, מוצע להאריך את תוקף הוראת השעה בשנתיים נוספות".
המשרד מציין, כי "בעיה מסוימת שעלתה ביישום החוק הייתה כי בתי המשפט התלבטו בשאלה האם פרקליט מחוז רשאי לעשות שימוש בשיקול דעתו על-מנת להעביר חומר חקירה לטיפול התביעה המשטרתית בעבירת עוון שעל-פי התוספת בטיפול הפרקליטות. אומנם ברוב רובם של המקרים בהם טען הנאשם לפסלות הגשת כתב האישום לאחר העברת חומר החקירה כאמור דחה בית המשפט את הטענה, אך התיקון מוצע על-מנת להסיר ספק ולהבהיר את סמכות פרקליט המחוז".