שני בכירים בפלג הצפוני של התנועה האיסלאמית נעצרו בחשד שקראו להפר את הסדר בהר-הבית. הם הובאו לבית משפט השלום בירושלים לדיון בבקשת המשטרה להאריך את מעצרם.
במתחם ההר נפצעו הבוקר (יום ד', 18.9.13) שני שוטרים פצעים קלים מאבנים שיידו אליהם מאל-אקצה פורעים ערבים. השוטרים השתמשו בגז פלפל לפזר את המתפרעים, ועצרו שלושה מהם. כעת שקט במקום, והשוטרים מנעו מהמתפרעים לצאת מן המסגד.
עשרות יהודים שהגיעו הבוקר להר הבית מספרים כי שנים רבות לא נראתה בהר היערכות שכזו לאבטחת הסדר, היערכות המאפשרת ביקורים סדירים של אזרחים, למרות ההסתה המוקדמת של המוסלמים, הקוראת למוסלמים לבוא להתפרע במקום ולשבש את עליית היהודים.
העולים להר דיווחו כי בניגוד למקרים רבים בעבר, בהם המשטרה הייתה סוגרת את ההר ליהודים, לאחר כל יידוי אבנים של מוסלמים, הפעם כוחות משטרה מתוגברים לכדו את מיידי האבנים, והרחיקו את יתר המתגודדים. מתפרעים אחרים שנמלטו למסגד אל-אקצה, ננעלו מבחוץ, וביקורי היהודים נמשכו במקום.
עם זאת, המשטרה עדיין לא איפשרה ליהודים ביקור רגוע ושלו בהר. השוטרים דרשו מהעולים היהודים לנוע כל העת, ולא איפשרה להם לשהות ולהתעכב במקום אחד בהר, בגלל חששה להיווצרות מוקד לתסיסה מוסלמית. בארגוני המקדש שבים ודורשים ליצור הפרדה וחלוקה מוחלטת של הר-הבית ליהודים בחגי ישראל.
יהודה גליק, דובר ארגוני המקדש, שנכח בהר, בירך במקום את ח"כ מירי רגב, שכינסה מספר פעמים את ועדת הפנים שבראשותה יחד עם גורמי המשטרה, שהתחייבו לאפשר ביקורים סדירים של יהודים בכל מהלך ימי החג. "אור הזקורים שח"כ רגב הפנתה למקום הקדוש לנו, וטיפולה המהיר בכל התרחשות בהר הבית, הביאה לשיפור ניכר בהתייחסות הרשויות שהיום ניכרה היטב במקום" אמר.
דוד רפורט, שעלה אף הוא הבוקר להר הבית, סיפר שהמשטרה לא איפשרה כניסת עיתונאים שבאו לסקר את האירועים במקום. "השוטרים האיצו בנו למהר, בלי חיכוכים, והיינו על ההר כ-20 דקות בלבד. היה איתנו איש וואקף אחד שלא הפריע, כך שהיה ניתן לומר תהלים, פרשת התמיד ותפילות אישיות. כאשר לא המשטרה ולא הוואקף מתעניינים", סיפר.