פקודת בתי הסוהר, מאפשרת הפרדת אסיר בבית הכלא, כאשר הדבר נדרש מטעמים של בטחון המדינה; ביטחון בית הסוהר; שמירה על שלומם או בריאותם של האסיר או אסירים אחרים; מניעת פגיעה ממשית במשמעת ובאורח החיים התקין של בית הסוהר; מניעת עבירת אלימות, עבירה של עסקת סמים. אסיר קטין, מתאפשרת הפרדתו גם אם טובתו של הקטין דורשת את החזקתו בתא כשהוא לבדו.
החזקתו של אסיר בהפרדת יחיד (לבדו בתאו) עד לתקופה של חצי שנה, ובהפרדה זוגית (עם אסיר נוסף בתא) עד לתקופה של שנה, הן בסמכותו המנהלית של שירות בתי הסוהר. בית המשפט רשאי להאריך את תקופת ההפרדה.
ועדת חוקה, חוק ומשפט של הכנסת דנה היום בהצעות חוק של ח"כ
דב חנין וכן בהצעת חוק ממשלתית, הצעות המבקשות לקבוע, כי אסיר שנמצא בהפרדה ומובא לפני שופט להארכת תקופת החזקתו בהפרדה, יזכה לייצוג של הסניגוריה הציבורית. אלא אם האסיר הודיע שברצונו לא להיות מיוצג. זאת לעומת החוק הנוכחי, שמאפשר את הארכת החזקתו בהפרדה של אסיר אף אם אין לו סניגור.
בספטמבר 2012 הסניגוריה הציבורית פרסמה דוח בנושא אסירים בתנאי הפרדה. בדוח, מעלה הסניגוריה טענה לפיה "אמצעי ההפרדה, ננקט בישראל באופן בלתי מידתי ובניגוד להנחייתו הברורה של המחוקק, לפיה הפרדה תינקט כאמצעי אחרון בלבד, ובאין מוצא אחר". לטענת הסניגוריה, קיים מחסור בפתרונות חלופיים, להחזקה בהפרדה, וקיימת יד קלה על הדק ההפרדה.
עוד עולה מהדוח, 21 אסירים מוחזקים בהפרדה לתקופה של שנה עד שנתיים; 36 אסירים הוחזקו בהפרדה מעל שנתיים. בין היתר מציינת הסניגוריה כי קיימים אסירים המצויים בהפרדה 24, 23, 19 ו-9 שנים. הסניגוריה מתארת בדוח מצב קשה ובלתי אנושי של תאי ההפרדה. בחלק מהמקומות ציינו המבקרים כי מצב החדרים אינו מתאים לבני אנוש וכי הם עצמם התקשו לשהות בחדרים יותר ממספר דקות. עוד צוין בדוח, כי "קיימת התעלמות מטרידה ממצבן הפגיע במיוחד של קבוצות אסירים מסוימות המוחזקות בהפרדה, כגון אסירים הסובלים מלקויות נפשיות קשות ואסירים קטינים".
מדוח הסניגוריה עולה כי רק כמחצית מהמובאים להארכת הפרדתם בפני שופט, מיוצגים. עוד מציינת הסניגוריה, כי ב-97% (153 עתירות) התקבלה בקשת המדינה להארכת ההפרדה, לרוב, לתקופה המרבית המותרת. רק ב-5 עתירות נדחתה בקשת המדינה וב-5 נוספות העתירה התקבלה באופן חלקי, ובית המשפט הורה על הפרדה לתקופה פחותה מזו שהמדינה ביקשה. בכל 10 העתירות הללו היו האסירים מיוצגים. מכאן שהסיכוי של אסיר לא מיוצג לצאת מהפרדה, הוא - 0% ושל אסיר מיוצג 12%.
נציג שב"ס תת גונדר שמעון בר-גור אמר בדיון, "נכון לסוף שנת 2013 כלואים בשב"ס 20,000 אסירים. מהם, 120 כלואים בהפרדה. מתוכם, שישה אסירים ביטחוניים, שבעה קטינים, 70 אסירים בעלי אפיון פסיכיאטרי ו-19 חולי נפש".
הוועדה החליטה למזג את שתי הצעות החוק, להצעה אחת, ולאשר את ההצעה הממוזגת להצבעה בקריאה שנייה ושלישית במליאת הכנסת.
