איש בחברת נת"ע אינו חש אחראי למעשיו ולתוצאות החלטותיו. כך עולה מדוח
מבקר המדינה (יום ד', 29.10.14), המתמקד בסוגיית הרכש וסוגיית משאבי אנוש בחברה האמורה להקים את הרכבת הקלה בתל אביב.
תחום ניהול הרכש הוזנח כליל ובכלל זה אין איוש תקנים. למעשה, רק שליש מתקני הרכש מאוישים וכל שדרת ההנהלה של האגף לא מאוישת, לרבות מנהל הרכש ומנהל מגה מכרזים. השלכות העניין הן שכל מחלקה ואגף בנת"ע רכשו בעצמם, תוך התעלמות מחוק חובת מכרזים. נמצאו מקרים רבים של העדר נהלי רכש ומקרים חריגים של פטור ממכרז.
בלגן התגלה גם בניהול הפיננסי. אין מידע מהימן על התקשרויות בחתכי זמן שיסייעו במעקב אחר ניהול התקציב. מכרזים אסטרטגיים פורסמו ושונו מספר רב של פעמים - מה שמעיד על הכנה חובבנית של המכרז.
פרויקט הענק של קופסת התחנה התת-קרקעית באזור אם המושבות ניתן ללא מכרז כ"אופציה" לקבלן שכבר מבצע עבודה באותו אזור (פיר אם המושבות). פרויקט פירי המנהרות היה אמור להסתיים בספטמבר 2012 אך בפועל טרם הסתיים.
בתחום משאבי אנוש, מתוך 288 תקנים בנת"ע נכון לאוקטובר 2013, 113 משרות אינן מאוישות לרבות משרות ניהול בכירות - יועמ"ש, מנהל משאבי אנוש. במחלקות הקריטיות, תכנון וקו אדום נמצאו 45-36 אחוזי אי-איוש. הליכי הגיוס של נת"ע אינם שיטתיים, נמשכים זמן רב ומבוססים בעיקר על התרשמות אישית. ההליכים יוצרים את הסכנה למינויי מקורבים. יצוין, כי יו"ר נת"ע, אלכס ויז'ניצר, הסכים להעסיק את בתה של השרה
סופה לנדבר כמנהלת משאבי אנוש החדשה של החברה.
הממצאים שהועלו בדוח מצביעים על ליקויים משמעותיים בנת"ע, אף על-פי שכבר חלפו יותר משלוש שנים ממועד החלטת הממשלה מ-2010 להעביר את הרכבת הקלה לניהולה של החברה. ליקויים אלה בהיערכות הארגונית של נת"ע עלולים להזיק להתקדמות הפרויקט. על החברה לשפר את תפקודה ולהתאימו לצרכים הנדרשים לניהול פרויקט מורכב בעלות גבוהה מאוד. כמו-כן קובע המבקר, כי על
משרד התחבורה ומשרד האוצר לפקח על החברה כדי להבטיח שהפרויקט יצליח.
- מנת"ע נמסר כי לפני כחצי שנה עברה מהפך ארגוני, הכולל החלפת רוב ההנהלה הבכירה, כדי שתוכל לעמוד באתגר. לדבריה, הדוח עוסק בתקופה שקדמה למינוי המנכ"ל וצוותו, וכבר שונו באופן ממשי דפוסי פעולתה והתנהלותה. "נת"ע פעלה ופועלת לתיקון הליקויים עליהם הצביע המבקר, תוך שהקשתה על עצמה ביישום כללי מנהל תקין מחמירים וקפדניים, כפי שמצופה מחברה ממשלתית ציבורית שבפניה משימה לאומית אדירת ממדים", לשון התגובה.
