אחרי כחמש שנים של דיונים, הרמטכ"ל רא"ל גדי איזנקוט אישר (יום א', 25.9.16) את פקודת השירות המשותף שתסדיר את הנהלים הקשורים לשירות של אוכלוסיות ומגדרים שונים בצבא זה לצד זה.
פקודת השירות המשותף מסדירה בחוקי המטכ"ל בין השאר את ההנחיות להשתתפות בטקסים רשמיים - כמעט כל החיילים יחויבו להשתתף בטקסים בהם נשים שרות. הפטורים היחידים מהשתתפות יינתנו לחיילים המשרתים במסגרות חרדיות. אולם על חיילים חרדיים ודתיים שאינם משרתים ביחידות אלה יכפה הצבא השתתפות.
רק באישור אלוף, בעת חרום, תאושר לינת חיילים וחיילות במבנה אחד, כל עוד תהיה ביניהם מחיצה, ושהאישור יינתן לשבוע אחד.
הפקודה האמורה פוגעת פגיעה קשה בזכויותיהם של חיילים שומרי מצוות, כך למשל:
- קצינים ונגדים דתיים לא יוכלו להיפטר אוטומטית משירות ביחידה מעורבת כפי שיוכלו חיילים להיפטר.
- הזכות לסרב לשרת ביחידה לוחמת מעורבת תישמר רק לחייל שהודיע מראש על כך שיש מבחינתו מניעה מפאת אורח חיים דתי, ואילו נימוקים ערכיים אחרים לסירוב לא יתקבלו.
- הפקודה אינה נותנת מענה לחיילים ששובצו ביחידה מעורבת ובמהלך שירותם חזרו בתשובה.
- בשטחים משותפים לשני המינים (כגון מועדון היחידה) חיילים מורשים להיות בלבוש אזרחי, וחוסר ההגבלה בעניין עשוי להדיר חיילים דתיים מהגעה לשטחים אלה.
קשיים על שחרור מפעילות הנוגדת אורח חיים דתי - חיילים דתיים יחויבו להשתתף בטקסים רשמיים גם אם שרות שם זמרות.
- שחרור חיילים מפעילות הווי עם תוכן הנוגד את אמונת החייל הדתי לא יהיה אוטומטי ויותנה בהסכמת מפקדיו.
- ככלל, יערים הצבא קשיים על בקשות חיילים דתיים להיפטר מפעילות הנוגדת את אמונתם - יחייב הגשת בקשות בפרק זמן סביר מראש ולא כפי שהיה נהוג עד היום לאשר לאלתר; וכן לא יאפשר למפקדיו הישירים של החייל לאשר בקשות שכאלה אלא יחייב את העלאתן לדרג פיקוד גבוה יותר.
- צה"ל לא יציע לחיילים דתיים שאינם יכולים להשתתף בנופש מפאת היותו מעורב - נופש חלופי.