לבג"ץ אין סמכות לדון בסדרי התפילה ליד הכותל המערבי, שכן מדובר בענייני דת המסורים על-פי החוק לרשות המבצעת בלבד. כך טוענת (21.8.17) הרבנות הראשית בנייר עמדה שהגישה לבג"ץ, לקראת הדיון בעתירות הדורשות לקבוע בכותל מתחמי תפילה לרפורמים, לקונסרבטיבים ולארגון נשות הכותל.
לדברי הרבנות, העותרים רוצים להוסיף סימני פולחן משלהם, תוך פגיעה באחרים ובהסדרים הקיימים, חריגה בוטה מהנהוג בכותל לאורך דורות רבים וחילולו של הכותל. הסעדים המבוקשים הם "עניינים הלכתיים מובהקים הנמצאים בליבת הפולחן הדתי", כאשר החוק והפסיקה - כולל של בג"ץ עצמו - קובעים שהללו מסורים רק בידי הרשות המבצעת ושאינם בני שיפוט. ניתן להניח שבג"ץ לא יתערב בסדרי התפילה בכנסיית הקבר או במסגד אל-אקצה, מוסיפה הרבנות.
"לא מדובר בהכרעה משפטית אלא בהחלטה דתית-ערכית. בתי המשפט אינם הטריבונל המתאים להכריע אם ניתן לשנות את ההלכה ולחלל את המקום הקדוש או לאפשר כפיית סממנים פולחניים חיצוניים שאינם מקובלים על רובם המוחלט על הפוסקים הדתיים, ואשר יגרמו למחלוקת, לפילוג ולהפרת הסדר הציבורי שיביאו לחילול הקודש", טוענת הרבנות. היא גם מזהירה, שהתערבות בג"ץ בנושאים אלו תגרום לפגיעה חמורה באמון הציבור בו.
לדעת הרבנות, רק היא והרבנים הראשיים לישראל מוסמכים להכריע בשאלות אלו, מתוקף מעמדם החוקי, מומחיותם ועשרות שנים בהן כך היה מקובל. היא טוענת, כי קדושתו של הכותל נמשכת גם לחלקו הדרומי, המקום בו הוצע להקים מתחמי תפילה נפרדים. פגיעה במנהג המקום בכותל עלולה להפוך אותו למקום מריבה, ויש לשמור על המכנה המשותף הרחב ביותר לציבור המתפללים. קיום תפילה מעורבת מהווה חילול קדושת הכותל המערבי, שכן הרפורמים והקונסרבטיבים שונים בצורה דרסטית מהיהדות הנהוגה מדורי דורות.
חופש הפולחן של איש אינו נפגע בכך שהוא מתפלל בכותל כפי שהוא כיום, ממשיכה הרבנות, ובכל מקרה - יש לאזן בינו לבין רגשות הציבור, כפי שקובע החוק. נשות הכותל ממציאות כל העת פולחנים חדשים, וכל עניינן הוא בעשיית פרובוקציות - מאשימה הרבנות. הן מנסות לכפות באמצעות בית המשפט עמדה הלכתית שאינה מקובלת על רוב קהילות ישראל, והיענות להן תגרום גם היא לחילול הכותל ותפתח פתח לריבוי אין-סופי של מנהגים ומחלוקות.
לבסוף טוענת הרבנות, שהעתירות לא הוגשו
בתום לב, אלא כ"חלק ממאבק נרחב יותר של התרסה כנגד 'מיושנות' הדת ומוסדותיה וקידום מאבקים להכרה ממלכתית או מאבקים פמיניסטיים על גבו של הכותל המערבי ועל גב הציבור הרחב המעוניין להתפלל במקום הקדוש". לדבריה, מדובר בהפגנות במקום קדוש וביצירת התגרויות.
