מועצת המכינות הקדם-צבאיות הודיעה (יום ה', 7.6.18) כי היא ממליצה על סגירה הזמנית של מכינת בני ציון שעשרה מתלמידיה נהרגו באסון בנחל צפית.
בהודעה שנמסרה מטעם המועצה, נמסר כי "המועצה רואה ערך גדול בהמשך קיומה של מכינת בני ציון כחלק ממפעל המכינות. הוועד המנהל של מועצת המכינות החליט להציע למכינת בני ציון שותפות בתהליך בנייתה מחדש, בתהליך ציבורי שקוף שהמועצה חלק ממנו. הוועד המנהל של מועצת המכינות סבור שאין לפתוח את המכינה לפני השלמת התהליך". עוד נמסר כי "החלטת הוועד המנהל הועברה לנציגי משרד החינוך, משרד הביטחון ומכינת בני ציון".
באסון שאירע בנחל צפית נספו תשע נערות ונער אחד, תלמידי המכינה ומועמדים ללימודים במכינה. הנערים שיצאו לטיול גיבוש בנחל צפית נקלעו בדרכם לשיטפון עז, ונסחפו בערוץ הנחל.