המשטרה מגיבה בחריפות לטענותיו של ראש ה
ממשלה לשעבר,
אהוד ברק, כאילו היועץ המשפטי לממשלה
אביחי מנדלבליט הגביל את המשטרה בחקירת פרשת כלי השיט, ומכנה אותן שקריות.
בהודעה חריגה, מבהירה המשטרה כי הטענות לפיהן חקירת תיק 3000 הוגבלה או צומצמה על-ידי מי מבכירי מערכת אכיפת החוק היא טענת כזב, חסרת כל בסיס עובדתי. ביקורתה של המשטרה מופנית, ככל הידוע, גם נגד דבריו של שר הביטחון לשעבר, ח"כ משה (בוגי) יעלון.
ברק טען כאילו ראש הממשלה
בנימין נתניהו לא נחקר בנושאים עליהם היה צריך לחקור אותו וכאילו כבל היועמ"ש את ידי החוקרים כך שלא תבוצע חקירה רחבה - אלא מיקד את המשטרה בחקירת נקודות מסוימו. כמו-כן נטען, כי כתוצאה מכך לא נחקרו יחסי משרד רה"מ ומשרד הביטחון, בין נתניהו למשה יעלון, מכתבו של נתניהו לאנגלה מרקל כאילו נסוגה ישראל מהתנגדותה למכור צוללות משודרגות למצרים ושאר טענות סרק.
בהודעת המשטרה נאמר כי "החקירה נוהלה באופן יסודי ומקצועי, מתוך מטרה אחת ויחידה של בירור האמת. במסגרת החקירה נגבו הודעותיהם של בכירי המדינה ומערכת הביטחון בעבר ובהווה, וכל טענה שעלתה ואשר הצדיקה העמקת הבירור - נבדקה לעומקה. אין כל שחר לטענות שמרמזות את ההפך".