אילן יוסף יוחזר לתפקידו כממונה מדור חקירות במחלקת חקירות מע"מ ירושלים. נציבות שירות המדינה ביטלה את השעייתו, ימים אחדים לאחר שעתר לבית המשפט בדרישה לעשות זאת, והודיעה על כך (16.12.18) לבית הדין האיזורי לעבודה בירושלים.
יוסף הואשם ביולי 2013 בעבירות שוחד, מרמה ועוד בשולי פרשת קופת חולים מאוחדת. המדינה טענה, כי הוא היה מעורב בהדלפת מידע על החקירה לאברהם סיבוני, אחד מספקיה של המאוחדת, תמורת שוחד. יוסף זוכה לאחר ארבע שנים בידי בית המשפט המחוזי, ובחודש שעבר דחה בית המשפט העליון את ערעור המדינה על זיכויו.
יוסף הושעה מעבודתו עם תחילת החקירה, וגם לאחר זיכויו החלוט סירבו רשות המיסים ונציבות שירות המדינה להחזירו לעבודה, בנימוק שהנציבות עדיין בוחנת את ההיבטים המשמעתיים של הפרשה. אולם לאחר שיוסף פנה לבית הדין, החליט אגף המשמעת בנציבות לבטל את השעייתו והוא גם יקבל את זכויותיו בגין תקופת ההשעיה.
