הבולשת הפדרלית ניהלה באמצע 2017 חקירה בחשד שהנשיא
דונלד טראמפ משרת אינטרסים רוסיים נגד האינטרסים של ארה"ב. החקירה הועברה לידי התובע המיוחד,
רוברט מולר, אשר מונה ימים אחדים לאחר מכן - חושף (שבת, 12.1.19) ניו-יורק טיימס.
החקירה נפתחה לאחר שטראמפ פיטר את מנהל הבולשת,
ג'ים קומי, בשל טיפולו בפרשה הרוסית. משמעותה הייתה, שאנשי הביון הנגדי של ה-FBI היו צריכים להחליט האם נשיא ארה"ב מהווה סכנה לביטחון הלאומי. הם גם בדקו האם הוא עובד ביודעין עבור רוסיה, או שהוא נמצא שלא בידיעתו בהשפעתה של מוסקבה. חקירה זו הייתה הסתעפות של החקירה שקיומה ידוע זה מכבר: האם טראמפ שיבש את חקירת הפרשה הרוסית בכך שפיטר את קומי.
לדברי הטיימס, אנשי הבולשת חשדו בקשריו של טראמפ עם רוסיה כבר במהלך קמפיין הבחירות שלו, אך נמנעו מלפתוח בחקירה נגדו - בין היתר משום שלא ידעו כיצד לנהל אותה, על כל המשתמע ממנה. אך לאחר פיטוריו של קומי, במאי 2017, הגיעו ראשי ב-FBI למסקנה שאין מנוס מקיום החקירה. לא ידוע האם מולר המשיך או ממשיך לקיים את אותה חקירה, והטיימס מצטט מקורות ברשויות אכיפת החוק שמחוץ לבולשת הטוענים שעצם פתיחתה הייתה מוגזמת.
הבולשת איחדה את החקירה הפלילית וחקירת הביון, משום שפיטוריו של קומי נתפסו כמלמדים על אחת משתיים: עבירה פלילית של שיבוש הליכים או קשר עם מעצמה עוינת. מי שהיה היועץ המשפטי של ה-FBI עד שלהי 2017, ג'יימס בייקר, אמר לטיימס, כי אם טראמפ פיטר את קומי כדי להפסיק את חקירת הפרשה הרוסית - יש לכך השלכות ברורות בתחום הביטחון הלאומי, משום שהדבר ימנע לרדת לעומק התערבותה של רוסיה בבחירות לנשיאות.
טראמפ "עלה על הכוונת" של סוכני הביון הנגדי לאחר שביולי 2016 קרא לרוסיה למצוא את תכתובות הדוא"ל הנעלמות של
הילרי קלינטון. מולר טוען כעת, כי באותו יום עצמו החלו פצחנים שפעלו בשירותה של ממשלת רוסיה בפעולות החדירה לשרתים של קמפיין קלינטון ושל המפלגה הדמוקרטית, אם כי הוא לא אמר (בכתבי האישום שהגיש) האם מדובר בצירוף מקרים או בהיענות מכוונת לקריאתו של טראמפ. מידע נוסף שעורר את תשומת ליבה של הבולשת הועבר בידי כריסטופר סטיל, לשעבר סוכן ביון בריטי, אשר טען, כי לרוסיה יש מנופי סחיטה על טראמפ בדמות תיעוד מפגשיו עם פרוצות במלון במוסקבה.
הבולשת חקרה, בחודשים שלפני הבחירות, את הקשרים בין ארבעה מאנשי טראמפ לבין רוסיה. היא סברה שיש לראות קשרים אלו גם על-רקע נסיונה העקרוני של רוסיה לחבל בבחירות בארה"ב, כדי לגרום לפקפוק בתוצאותיהן. השאלה האם מדובר היה בקנוניה עלתה מאוחר יותר. אולם החקירה לגבי טראמפ עצמו הושהתה עד שבכירי הבולשת סברו שמעשיו-שלו מעוררים את הצורך לפתוח בה.
הפעולה המשמעותית ביותר הייתה פיטוריו של קומי, אך לדברי הטיימס נלוו אליה שתי פעולות נוספות. האחת הייתה טיוטת מכתב הפיטורין של קומי, אותה הכין טראמפ אך לא שלח, ובה ציין במפורש את החקירה הרוסית כעילה לפיטוריו. המשנה לשר המשפטים,
רוד רוזנשטיין, הכין טיוטה מרוככת והשמיט ממנה את הפרשה הרוסית; טראמפ הורה לו לכלול אותה בכל זאת, אך רוזנשטיין סירב. לבסוף הוסיף טראמפ משפט בו הודה ל-קומי על כך שאמר לו שלוש פעמים שהוא אינו יעד בחקירה.
הפעולה השנייה הייתה ראיון שהעניק טראמפ לרשת NBC יומיים אחרי פיטוריו של קומי, בו אמר במפורש שהפרשה הרוסית הייתה עילה לפיטורין. עוזריו של טראמפ טענו, כי קריאה קפדנית של דבריו מלמדת שהפיטורין לא נועדו להביא לסיומה של החקירה - ולכן אין המדובר בשיבוש הליכים. סוכני הבולשת התווכחו האם לפתוח מיד בחקירה, והחליטו בחיוב. הם מצאו חיזוק בדיעבד להחלטתם בכך שבפגישה בחדר הסגלגל עם אישים רוסים ימים אחדים מאוחר יותר, אמר טראמפ: "זה עתה פיטרתי את ראש ה- FBI הוא היה משוגע, ממש מטורף. היה עלי לחץ גדול בגלל רוסיה וכעת הוא הוסר".
כתבי האישום שהגיש מולר עד כה בפרשה הרוסית, אינם קושרים במישרין את טראמפ ליחסים בין הקמפיין שלו לבין גורמים רוסים, וגם לא נטען בהם שהייתה קנוניה מתוכננת ומתואמת בין הצדדים להשפיע על הבחירות. כמו-כן, לא הוצגו עד כה בפומבי ראיות כלשהן לכך שטראמפ שירת במודע אינטרסים רוסיים. עורך דינו,
רודי ג'וליאני, המעיט בחשיבותה של החקירה שחשף הטיימס: "העובדה שמדובר בסיפור מלפני שנה וחצי וששום דבר לא צף בתחום הביטחון הלאומי, מלמדת שהם לא גילו דבר".
