בצה"ל הפעילו את פקודת "קרן אור", לטיפול בהתפשטות הנגיף. כחלק מהצעדים, החל צה"ל להכשיר לוחמים לסיוע באכיפת הסגר אם יוחמרו ההגבלות. בנוסף הוחלט להכשיר שני גדודים בפיקוד העורף לטהר אזורים מקורונה, על בסיס היכולת לטיהור אב"ך. כמו-כן, יוכנס כוח רפואי שיאפשר סיוע למערכת הבריאות באמצעות חובשים וכוחות עזר רפואי וסיוע לאזרחים ותיקים. צה"ל גם יפעל לשמור על קווי אספקה פנימיים וחיצוניים לחו"ל.