במהלך המאבק של אנשי בית שאן על פתיחת הגישה לנחל האסי בניר דוד, טען הקיבוץ שאילו אנשי בית שאן היו מוכנים להשקיע - היו יכולים לפתח לעצמם מוקדי תיירות ונופש על גדות הנחל העובר בעירם. מתברר שלטענה זו אין רגלים. ממפת מקורות זיהום נחלי ישראל המתפרסמת באתר משרד איכות הסביבה עולה ששיקום נחל חרוד העובד בבית שאן תלוי בהפסקת זיהום המים על-ידי בריכות הדגים של ניר דוד ומסילות.
נחל חרוד בדרכו אל הירדן, חוצה שלוש מדרגות. המדרגה העליונה, שעליה בנויה העיר בית שאן, המדרגה התיכונה של כיכר הירדן (ע'ור). והמדרגה השלישית של גאון הירדן. כל אחת מהמדרגות נמוכה מקודמתה וכתוצאה, המים הזורמים בנחל יוצרים מפלים מרהיבים אלא שהמים המזוהמים מבריכות הדגים של ניר דוד ומסילות, הזורמים באפיק הנחל, לא מאפשרים לשקם את הנחל ולפתח את גדותיו.
המאבק בזיהום בריכות הדגים של ניר דוד ומסילות מהוות אחד ממקורות הפרנסה העיקריים של שני הקיבוצים. בניר דוד ממוקמת המעבדה המרכזית לבריאות דגים שנוסדה בשנת 1944 כמעבדת מחקר של האוניברסיטה העברית וארגון מגדלי דגים בישראל. לפני מספר עשורים עברה המעבדה לאגף לדיג וחקלאות מים של משרד החקלאות ופיתוח הכפר והיא עוסקת בתחום בריאות הדגים ואיכות המים הנחוצים לגידול דגים. כך שאין לטעון שהקיבוץ אינו מודע לנזקי הזיהום הנובעים מבריכות הדגים.
עמותת צלול המנהלת מאבק ארוך למניעת ההזרמה של פלט מזוהם בהפרשות דגים, חומרי הזנה ותרופות הגורם לזיהום הנחלים ואינו מאפשר את שיקומם. בעקבות דרישת העמותה אושרה רפורמה הכוללת שינוי בהליך הזנת הדגים, הקמת מערכות סינון, הקמת מערכות שיקוע, טיפול בבוצה, טיפול בזרחן, חיטוי והקמת אגנים ירוקים, בעלות של כ-120 מיליון שקל. הרפורמה אינה מיושמת במלואה בשל טענות המגדלים בדבר אי-רווחיות הענף. בשנים האחרונות נסגרו מספר מדגים בארץ אבל לא בקיבוצים לאורך נחל חרוד ובקיבוצים במועצה אזורית עמק המעיינות. עמותת צלול טוענת שהמשרד לאיכות הסביבה שהיה אמור לפקח על הזרמת מזהמים לנחלים - אינו עושה זאת.
צפיפות ולכלוך אחד הנימוקים המרכזיים של קיבוץ ניר דוד נגד פתיחת גדות נחל האסי והפיכתם לאתר נופש פתוח לציבור, הוא הטינופת והרס הסביבה הכרוכים במהלך שכזה. מתברר שהקיבוץ עצמו מקדם מהלכים להפיכת גדות הנחל לאזור תיירות ונופש מסחרי בבעלותו. בנוסף לצימרים הקיימים בקבוץ ובנוסף לחברת חווית ניר דוד המספקת אירועי נופש ותיירות על גדות הנחל, לקיבוץ יש תוכנית לבנות שם בית מלון בשטח של 15 דונאם כולל מסעדות ובתי קפה שיגבו כסף טוב מכל מי שייכנס אליהם.
משרד איכות הסביבה וקיבוץ ניר דוד לא מסרו תגובה.
