במהלך סוף-השבוע פרסו יחידות צה"ל ציליות כדי לאפשר לחיילים תפילות בציבור במרחב הפתוח. בהוראת הרבנות הצבאית הראשית, נותרו בתי הכנסת פתוחים אך מלבד לימוד של יחידים, לא מתאפשרת בהם תפילה.
עם זאת, בדומה ליתר הארץ, הותרה התפילה בתוך בתי הכנסת במהלך צום יום הכיפורים. למשך 26 שעות, ייפתחו בתי הכנסת בצה"ל לתפילה, ויפעלו על-פי התנאים הבאים:
- קבוצות (קפסולות) - יתפללו בתוך בתי הכנסת, עד 20 איש, וללא ערבוב ביניהן.
- ציבור מתפללים שאינו בקבוצה אחת:
- בבית כנסת גדול, שמאפשר תפילה במרחקים כנדרש - באישור אל"ם - התפילה
תתקיים עד 20 מתפללים בתוך בית הכנסת.
- בבית כנסת קטן, שאינו מאפשר תפילה במרחקים כנדרש - התפילה תהיה במרחב
הפתוח ולא בתוך מבנה בית הכנסת.
- כל תפילה במרחב הפתוח, תהיה עד 30 מתפללים.
בגלי צה"ל דווח כי מספר המאובחנים בצה״ל זינק. בתוך יומיים נרשמה עלייה של כ-30% במספר החיילים שנדבקו בקורונה. על הפרק: עוצר יציאות כללי בצבא אחרי כיפור. בהוראת הרבנות הצבאית, על כל חייל בחופשה להתפלל במרחב הפתוח.
ענף הלכה ברבנות פרסם הנחיות שונות לחיילים בצל מגבלות הקורונה. על-פי ההנחיות, מי ששוהה בבידוד - יצום כרגיל. חולה שנדבק ויש לו תסמינים קשים (קוצר נשימה, חום חולשה יתרה) - יאכל וישתה כפי צורכו. עם זאת, חולה חיובי לנגיף שמרגיש טוב ואין לו תסמינים - יצום. מרגיש לא טוב או שיש לו תסמינים קלים - צריך לאכול ולשתות לשיעורין בהתאם להלכות. גם מי שבקבוצת סיכון התבקש שלא להחמיר על עצמו ולאכול.
עוד נדרשו החיילים שלא לטבול במקווה אזרחי, כנהוג בערב כיפור, אלא לשפוך על הגוף בבת אחת תשעה קבין של מים (כ-3 דקות רצופות של מקלחת).
באתר סרוגים דווח כי השנה החליט צה"ל לבטל את ימי המילואים של הבני"שים, והם לא יגיעו לבסיסי צה"ל. המשמעות היא שלראשונה מזה עשרות שנים, בבסיסים רבים בארץ לא יהיה מי שידאג ויארגן את מנייני התפילות ביום הכיפורים. בדובר צה"ל אישרו את המידע ומסרו בתגובה: "כבכל שנה מתגייסים חיילים בני"שים בשירות ללא תשלום וכן אזרחים מתנדבים להשלמת מניינים בבסיסי צה"ל. השנה עקב העלייה בתחלואה והמצב הנוכחי, התקבלה החלטה להמעיט כניסת כוח אדם שאינו מבצעי לבסיסי צה"ל על-מנת למנוע הדבקה שתגרור פגיעה בכשירות הכוחות. הרבנות הצבאית תעשה ככל שניתן על-מנת לדאוג למניינים, סגלי הרבנות יסגרו את החג בבסיסים וידאגו לקיום התפילות ומנהגי היום כהלכתם".
בניגוד לשנים עברו, שבהן מסר דובר צה"ל באופן יזום באיזה בסיס ישהו במהלך כיפור הרמטכ"ל והרב הראשי לצה"ל, לא מוכנים השנה לגלות היכן ישהורא"ל
אביב כוכבי והרבצ"ר תא"ל הרב איל קרים, בטענה כי מדובר ב...צנעת הפרט.