חוקרי רשות ניירות חקרו בשלהי 2017 שורה של מעורבים במה שיתפתח לימים לתיק 4000, למרות שהיועץ המשפטי לממשלה דאז, אביחי מנדלבליט, אישר לחקור רק את מנכ"ל משרד התקשורת לשעבר, שלמה פילבר. כך עלה (13.2.23) בהמשך חקירתו הנגדית של יריב עמיעד, שהיה ראש צוות החקירה ברשות בתיקי בזק ו-4000. ראש צוות התביעה בתיק, עו"ד יהודית תירוש, אמרה שהפרקליטות אישרה חקירות אלו, כולל זיקה אפשרית לנתניהו, משום שהן נגעו לחשדות נגד פילבר - אך לא היו אז חשדות כלפי נתניהו עצמו. סניגורו של בנימין נתניהו, עו"ד בועז בן-צור, טען שמדובר היה למעשה בחקירה נגד נתניהו - בלא אישורו של מנדלבליט, כנדרש בחוק יסוד הממשלה. בן-צור עומד להגיש בקשה להגנה מן הצדק - לבטל את כתב האישום נגד נתניהו בתיק 4000 בנימוק שהחקירה נוהלה שלא כחוק. ב-27.9.17 כתב פרקליט המדינה דאז, שי ניצן, למנדלבליט: "יש מקום לחקירת פילבר עצמו בנושא מניעיו להיטיב עם בזק, בהקשרים שעלו מחומרי חקירה שנתפסו". לשכתו של מנדלבליט השיבה ב-2.10.17: "בהמשך לפנייתו של פרקליט המדינה ליועץ, היועץ אישר לפעול על פי המתווה שהציג פרקליט המדינה". עמיעד טען: "נאמר לי מהפרקליטות שאושר המתווה לחקור את פילבר ונוספים - שאול אלוביץ, אור אלוביץ ואלי קמיר". בן-צור: "'פילבר עצמו' זה הוא ורק הוא. מי אמר שאפשר לחקור אחרים?". עמיעד: "זה מה שהבנו. עבדנו מול הפרקליטות שליוותה אותנו". בן-צור: "מי אמר לכם ולמי? בכתב, בעל-פה?". עמיעד: "עבדנו במיילים. מי שליוו אותנו היו יהודית [תירוש] וציפי [גז]". השופט משה בר-עם שאל מתי עמיעד קיבל מיילים אלו, והוא שיער שהיה זה בין ישיבה שהתקיימה ב-1/2 באוקטובר לבין חקירתם של שאול אלוביץ ופילבר ב-23 בחודש. עמיעד ציין, כי האישור היה לחקור ב"נושאים מאוד ספציפיים" על פי תוכנית חקירה שהוא הכין. עוד הראה בן-צור, כי שמו של נתניהו עלה 93 פעמים בחקירתו של אלוביץ ברשות באוקטובר 2017. עמיעד השיב: "אלוביץ העלה לא פעם את שמו של נתניהו והחזרתי אותו לפילבר". בן-צור ציין, כי החוקרים לא הזהירו את אלוביץ שהוא חשוד במתן שוחד לנתניהו, ולמרות זאת - העלו בעצמם את שמו של האחרון. עמיעד: "חקרנו על הודעות ספציפיות שנגעו לפילבר, כולל פגישה שהוא ארגן בין נתניהו לאלוביץ. הנחקרים מיוזמתם דיברו על נתניהו או על הקשר איתו. בעשרות מקרים יכולנו לעשות פולו-אפ ולעשות שאלות המשך, ואנחנו כל הזמן חזרנו לגבולות הגזרה: איך פילבר פועל מולו [אלוביץ] כמנכ"ל משרד התקשורת ומעביר לו דברים שקשורים לסיקור בוואלה. יכולתי להטיח באלוביץ את הראיות שהיו לנו [על הקשר עם נתניהו ולא עשינו זאת]". עמיעד שאל את אלוביץ כמה פגישות היו לו עם נתניהו, והסביר בעדותו שהיה זה כדי לבדוק את ההקשר של הפגישה ביניהם שארגן פילבר. השופט משה בר-עם: "זה מלמד על כיוון חקירה מסוים, אני לא נכנס אם זה לגיטימי או לא". עמיעד שב ואמר, כי הדבר נגע לחקירת פילבר. בר-עם: "ניתן מנדט לחקור גם בזיקה לנתניהו?". תירוש: "ודאי, אחרת מה המניע שלו [של פילבר להיטיב עם בזק]?". בר-עם: "חשבתי שהחשד היה לגבי פילבר". תירוש: "כן, למה הוא מיטיב עם בזק. מספר מצומצם של ראיות העלו חשד שהוא לא פועל ממניע אישי שלו אבל בשל זיקה נתניהו-אלוביץ-וואלה. היה מנדט לחקור את פילבר על זה, גם למה הוא מתווך פגישה בין נתניהו לאלוביץ". בהמשך אמר עמיעד: "מה שאושר הוא גבולות גזרה בנוגע לפילבר, כולל האם זה קשור לנתניהו. לא נגענו בסיקור [של נתניהו בוואלה] עד ש[אילן] ישועה הגיע בסוף דצמבר". בר-עם: "איך חקירת אלוביץ בנוגע למעורבותו בפרסומים בוואלה קשורה לחשדות נגד פילבר?". עמיעד: "אלוביץ קיבל מפילבר, בתקופה מאוד קריטית לבזק, חוברת שמעלה טענה בנוגע לאופן הסיקור של נתניהו בוואלה. מה אלוביץ צריך להבין לגבי מה שמצופה ממנו? אז ברור שזה נוגע לחקירה".