הממשלה אישרה (יום א', 27.8.23) הקמת ועדת בדיקה ממשלתית לפרשת פגסוס, לה יהיו סמכויות של ועדת חקירה. את ההצעה הגיש שר המשפטים, יריב לוין, והיא אושרה למרות הסתייגויותיה הניכרות של היועצת המשפטית לממשלה, גלי מיארה, והתנגדות השב"כ והמטה לביטחון לאומי. בראש הוועדה יעמוד משה דרורי, לשעבר סגן נשיא בית המשפט המחוזי בירושלים ומי שנחשב לשופט לעומתי לפרקליטות. חבריה יהיו נוגה רובינשטיין, לשעבר הסניגורית הציבורית הראשית, ושלום בן-חנן שהיה ראש אגף בשב"כ. היא תקבל בין היתר את הסמכות לזמן עדים ולדרוש מסמכים, ותהיה מוסמכת להגיש המלצות אישיות ואף להמליץ על חקירה פלילית. לדברי לוין, הוועדה "תוסמך לבדוק את התנהלות גורמי המשטרה, הפרקליטות ומערכות הפיקוח עליהן, בכל הקשור לביצוע פעולות רכש, מעקב ואיסוף בכלים קיברנטיים אחר אזרחים ונושאי משרה. כל זאת בשל הצורך לבצע אסדרה מקיפה ולספק תשתית נורמטיבית לשימוש בכלים טכנולוגיים מתקדמים, על-מנת לחזק את אמון הציבור שנפגע בעקבות פרשת פגסוס, ונוכח הצורך להגן על הזכות לפרטיות מצד אחד, ולתת בידי גורמי האכיפה כלים אפקטיביים למאבק בפשיעה ובשחיתות מצד שני". לוין הוסיף: ״פרשת הרוגלות היא מהחמורות שנחשפו בשנים האחרונות. חשיפת האמת בעניין, ומניעת אירועים דומים של פגיעה אנושה בזכות אזרחי ישראל לפרטיות, היא חיונית וחשובה מאין כמותה. אני מצר על הסתייגות חלק מהגורמים המעורבים בפרשה החמורה לבדיקה מעמיקה של הנושא, חרף ניגוד העניינים החריף בו הם מצויים". ראש הממשלה, בנימין נתניהו, לא השתתף בדיון, שכן במשפטו עלה שימוש שעשתה המשטרה ברוגלה מתוצרת חברת NSO. לוין מסר, כי נפגש עם ראשי השב"כ והמוסד, והכניס את השינויים שהתבקשו במנדט של הוועדה. המשנה ליועצת המשפטית, גיל לימון, שב על ההתנגדות לכך שהוועדה תדון בתיקים פתוחים (כולל תיקי נתניהו). לוין השיב: "אנחנו לא דנים על זכויות נאשמים, אלא על בדיקת פעולות גורמי אכיפת החוק". שר האוצר, בצלאל סמוטריץ, טען: "יש כאן כאלו שיעמדו להפוך לנאשמים, ועליהם הם רוצים להגן". לוין טען שהוועדה הפנימית שבדקה את הפרשה - בראשות המשנה ליועצת המשפטי דאז, עמית מררי - לא הוגבלה בבדיקת תיקים פתוחים, "כי שם ידעתם שיגנו עליכם". לימון הגיב: "ועדת מררי לא בדקה תיקים פתוחים". לוין המשיך במתקפה על לימון: "חמור מאוד בעיני שאתם מתערבים, זה ניגוד עניינים. חמורה מכך היא העובדה שהתהליך כולו לווה על-ידי היועצת המשפטית של משרד המשפטים, שרק אחרי שמיארה התערבה - היא נאלצה לשנות את חוות הדעת שלה והתנגדה, כי היא כפופה לה". חברי הוועדה כבר התכנסו להתייעצות ראשונה והחליטו לפרסם בתקשורת הזמנה למי שמעוניינים להעיד בפניה. הם גם החליטו לזמן את מיארה לישיבה הראשונה של הוועדה, כדי לשמוע במלואה את עמדתה בנוגע לשאלה של בדיקת השימוש ברוגלות בהליכים תלויים ועומדים. חברי הוועדה אומרים, כי היא "תפעל בכל עת לאזן בין זכות היסוד לפרטיות לבין עבודה יעילה של רשויות האכיפה, וכמובן תשמור שמירה מלאה על זכויות כלל המעורבים בהליך הפלילי".