במהלך מערכת הבחירות לנשיאות בארצות הברית נחשפה המעורבות של קטר וערוץ אל-ג'זירה במערכת הפוליטית האמריקנית. המעורבות הזו הפכה לאחד הנושאים המעסיקים גם את אמצעי התקשורת הערביים במזרח התיכון.
ב-11 בנובמבר, כשביקש כתב אל-ג'זירה בארה"ב לראיין את הנשיא הנבחר
דונלד טראמפ הוא נענה בתגובה "בקרוב אסגור לכם את העסק", ואז הפנה לו טראמפ את גבו והלך.
על-פי גורמים אמריקנים, קטר תמכה במיליוני דולרים באגודה של
ביל קלינטון - נשיא ארה"ב לשעבר ובעלה של המתמודדת הדמוקרטית לנשיאות
הילרי קלינטון. נג'יב אלנעימי, שר המשפטים לשעבר של קטר, שהתפטר מהממשלה בגלל מעשי שחיתות שפשו בה, סיפר ב-15 בנובמבר בראיון שהעניק לעיתון המצרי "אלווטן" כי קלינטון עצמו ביקר בקטר וחנך פרויקטים שונים שתמכו בו בהמשך. קטר בחשה במערכת הבחירות האמריקנית והיה לה אינטרס שהילרי קלינטון תיבחר לנשיאה.
אולם, המעורבות של קטר וערוץ אל-ג'זירה איננה רק בנעשה בארצות הברית, הם מתערבים בנעשה במדינות ערב ובמיוחד בנעשה במצרים. אלנעימי חשף בראיון את מעורבות תנועת "האחים המוסלמים" במערכת השלטון בקטר ואת האופן שבו השתלטה על התקשורת המקומית במדינה ועל ערוץ אל-ג'זירה. בראיון אישר אלנעימי למעשה את הטענות של משטר א-סיסי, כי קטר וערוץ אלג'זירה חותרים נגד המשטר המצרי.
שלטונות מצרים פועלים מאז הדחתו של הנשיא
מוחמד מורסי מהשלטון באוגוסט 2013 לצמצום פעילות ערוץ אל-ג'זירה במדינה, בין היתר שובשו שידורי התחנה הנקלטים באמצעות הלווין "ניילסאט", נעצרו שישה מעובדיה ואף נאסרו שידוריה במצרים.
שר המשפטים לשעבר של קטר סיפר בראיון כי אנשי "האחים המוסלמים" שנמלטו ממצרים ומצאו מקלט מדיני בקטר הצליחו להשתלט על אמצעי התקשורת המקומית בקטר ובאופן מלא על ערוץ אל-ג'זירה. לדבריו, בתחילת הקמתו התנהל אל-ג'זירה על-פי קני המידה הבינלאומיים אולם בחמש השנים האחרונות החלו להתערב בו ידיים (זרות) שגרמו ל"ריקבון" בערוץ. "ערוץ אל-ג'זירה משקר ומפברק ומפר את הקריטריונים הבינלאומיים בניהול התקשורת וניהול השידור החי והמוניטין שלו מזיק לאמינות של קטר ביחס למצרים", אמר אלנעימי.
שר המשפטים הקטרי לשעבר סיפר כי הפסיק לעקוב אחרי שידורי הערוץ בגלל השקרים שהוא משדר על סוריה ומצרים ובנושאים נוספים. הוא ציין גם כי "האחים המוסלמים" פועלת מאחורי הקלעים של הפוליטיקה הקטרית, "כל עוד הדבר נמשך לא יהיו יחסים טובים בין קהיר לדוחא. האחים המוסלמים שולטים באופן מוחלט בתקשורת בקטר והם מסבכים את קטר למשל עם מצרים, שהיא המנהיגה של העולם הערבי. אם נפסיד את מצרים אירן תהיה הכוח המוביל", הסביר.
אלנעימי טען כי העם בקטר איננו תומך כולו באחים המוסלמים וכי מי שתומך בתנועה הם מרכזי "אלדעווה" ואגודות הצדקה אשר אוספות עבורם כספים רבים ו"גונבות את העם הקטרי לאור יום". "איש בשלטון בקטר איננו מאמין ברעיונות של האחים המוסלמים. יש פה עניין של אינטרסים", אמר אלנעימי. שר המשפטים הקטרי לשעבר סיפר כי הגיש הצעה לנקיטת צעדים נגד האגודות התומכות באחים המוסלמים, אך כל העולם קם נגדו באמצעי התקשורת וטען כי מדובר בפעילות צדקה.
דבריו של השר הקטרי לשעבר, שהיה מקורב למערכת קבלת ההחלטות בקטר, מאשרים למעשה כי ערוץ אל-ג'זירה משמש כשופר של תנועת האחים המוסלמים בעולם הערבי ושל תנועת חמאס שהינה תנועת הבת שלה. מדיניות ערביות רבות האשימו במרוצת השנים שחלפו את ערוץ אל-ג'זירה באחריות להסתה והתססת ההמונים שהובילו להפרות סדר בהן. גם כיום ממשיך הערוץ לשרת את האג'נדה של תנועת "האחים המוסלמים", חמאס וארגון חיזבאללה במטרה לזעזע את המשטרים הערבים ובמיוחד את משטרו של נשיא מצרים א-סיסי שבקיץ 2013 הדיח מהנשיאות את מוחמד מורסי, אחד ממנהיגי התנועה במצרים.