דיון על יהדות וגנטיקה הוא נושא טעון. שנים רבות לאחר השואה, האזכור של המילים "יהודים", "גנטיקה" ו"גזע" באותו משפט היה עלול לגרום לפיצוץ, עקב אסוציאציות מיידיות לתורת הגזע הנאצית. ברם, הזמן עובר והנכונות לחקור את התשתית הגנטית של היהדות הולכת ונעשית רבה יותר. בשנים האחרונות הצטבר קורפוס נתונים מרשים בנושא. אומנם חלק מהממצאים עדיין שנויים במחלוקת ואחרים מעוררים אי נוחות, אך בסך הכול ניתן לומר שהיום אנו יכולים להגיד כמה דברים על מה שקיים או לא קיים במטען הגנטי שלנו. כתב העת היהודי-אמריקני Moment מביא מקבץ ממצאים מרעישים, עם פוטנציאל לא מבוטל לערער על התקינות הפוליטית. ובכן - תחזיקו חזק. חלק מהדברים שהאמנו בהם לגבי עצמנו אכן נכונים, ואחרים ממש לא.
ראשית, הגנטיקאים היום נוטים שלא לסווג את היהודים בתור "גזע נפרד", על-אף שכיום קיימת נטייה לומר שיש ממש במושג "גזע" כמכלול מאפיינים ביולוגיים מובחנים בין קבוצות אנושיות. מעניין לציין שראשית התפישה הגזעית כלפי יהודים הייתה בכנסייה הקתולית בספרד של ימי הביניים. יהודים שהתנצרו לא יכלו לכהן בתפקידי מפתח בכנסייה עקב העובדה ש"דם יהודי זרם בעורקיהם". עובדה זו אפשרה לפרופ' בן ציון נתניהו המנוח לטעון כי האינקוויזיציה בעצם סללה את הדרך לגזענות הנאצית.
אבל גם אם יהודים אינם גזע נראה שקיים אצלנו פרופיל גנטי מובחן, שניתן לזהות אותו גם אצל מי שרק אחד מהוריו או אפילו אחד מהורי-הוריו יהודי. התופעה הזו נגרמה, בין היתר, כתוצאה מכך שיהודים נהגו שלא להתחתן עם אנשים "מבחוץ". באחת התפניות האירוניות של הזמן האחרון, פעיל בתנועה הונגרית ימנית קיצונית בשם "יוביק" פנה לבדיקה גנטית על-מנת לשלול נוכחות של גנטיקה יהודית אצלו. מפלגתו אומנם הסתייגה מהעניין, אך החברה למבדקים גנטיים ערכה את הבדיקה, מתוך תפיסה שלא ניתן לסרב ללקוח.
מעניין לציין שגם בדיקות גנטיות בתוך העם היהודי מעלות ממצאים מעניינים. אחד מהם הוא שהשמועות על מוצאם הכוזרי של האשכנזים, רובם או כולם, היו מאוד מוגזמות (מדובר בתיאוריות שזכו בעבר לפופולריות לאחר פרסום ספרו של ארתור קסטלר, ולאחרונה הוקמו לתחייה על-ידי שלמה זנד במטרה להוכיח ש"אין עם יהודי"). מלבד זאת, ייתכן שיש ליהודים אינטליגנציה גבוהה יותר. הסיבה לכך היא, שוב, הנטייה להתחתן בתוך הקבוצה, שבגללה גם התכונות החיוביות (אינטליגנציה) וגם השליליות (נטייה למחלות גנטיות מסוימות) נוטות להופיע יותר אצל אותה קבוצה.
אפרופו מחלות גנטיות, ידועה העובדה שלאשכנזים יש נטייה לתסמונת טי-זקס, אך פחות ידוע שליהודים בכלל יש נטייה גנטית גבוהה יותר לכל בעיות העיכול, כולל אלרגיה ללקטוז וצליאק. בנוסף, אחוז אחד מהגברים האשכנזים פיתח עמידות חיסונית לנגיף האיידס ורוב היהודים נוטים פחות מבחינה גנטית להתמכר לאלכוהול (יוצאי דופן מהבחינה הזו הם העולים מרוסיה אחרי שנות ה-90). עם זאת, תוחלת החיים של היהודים לא גדולה יותר מבחינה גנטית, כך שכנראה שהטבע מאזן את הכול.
ולקינוח, כמה מילים על גנטיקה ודת. הגנטיקאי דין האמר, שאחראי בין היתר לגילוי הרצף הגנטי הקשור לדעתו לאמונה הדתית, "הגן הא-לוהי", מאמין שייתכן שהיהודים טיפחו את הגן הזה, על-ידי הימנעות מנישואין מחוץ לקבוצה. לכך הוא מוסיף את הממצא הידוע של "גן הכוהנים". מאידך, לא נמצא עד עתה רצף גנטי שמוביל, למשל, לשושלת בית דוד.
ועוד ממצא מעניין: הפלשתינים הם אכן בני דודים גנטיים שלנו. קיימת בינינו לבינם קרבה גנטית גבוהה, אף שבבניית פרופיל גנטי קבוצתי, הם נמצאים קרוב יותר לירדנים, לבדואים ולסעודים, בעוד אנחנו קרובים ל... דרוזים.
בסופו של דבר, חשוב לזכור שהגנום של כל בני האדם זהה ב-99%, וכן מוכח מדעית שמקור כל הדנ"א האנושי הוא מיחידה גנטית אחת של אישה אחת - שאותה נוהגים לכנות "חווה מיטוכונדריאלית".