אחד הסיבוכים המשמעותיים הנלווים לנזלת כרונית, הינו הפרעת שינה, בעיקר עקב החמרת הגודש האפי בשכיבה פרקדן. הפרעת השינה מתבטאת בקושי להירדם, בנחירות, בנשימה בלתי-סדירה ובדום נשימה בשינה.
כ-70%-80% מהחולים בנזלת אלרגית כרונית או עונתית, סובלים מירידה באיכות השינה ומעייפות כרונית. נמצא קשר ישיר בין נזלת כרונית לבין הפרעות שינה, ירידה בתפקוד היומיומי וירידה בהישגים בעבודה ובלימודים. קשר זה דווח ב-80% מהלוקים בנזלת אלרגית בחומרה בינונית עד קשה וב-40% מהחולים אשר מחלתם הוגדרה כקלה.
עייפות כרונית היא לרוב תוצאה ישירה של הפרעות בשינה, אך 43.7% מהחולים מדווחים על עייפות רבה במהלך היום, כאבי ראש עם הקימה בבוקר וכן ישנוניות, וזאת גם ללא הפרעות בשינה.
בילדים ומבוגרים הסובלים מנזלת אלרגית, נצפתה גם ירידה בתפקוד קוגניטיבי. במחקר מבוקר נמצא שכישורי הלמידה של חולים הסובלים מנזלת אלרגית עונתית שטופלו בפלצבו - היו ירודים משמעותית בהשוואה ללוקים בנזלת אלרגית אשר טופלו באנטי היסטמינים שלא מדור ראשון. במחקר אחר שבוצע במהלך עונת הפריחה נמצאה ירידה ביכולת העיבוד הקוגניטיבי וירידה בזיכרון הפעיל.
בנוסף, דווח על הפרעות התנהגותיות וירידה בכישורים חברתיים במבוגרים ובילדים, הסובלים מנזלת אלרגית. 28.1% מהילדים "האלרגים" בגילאים ארבע עד שבע סובלים מאי-שקט ומהפרעות התנהגותיות בעונת הפריחה, בהשוואה ל-6% מהבריאים.
ובשורה התחתונה - לימודיהם של ילדים ומבוגרים צעירים מושפעים מהמחלה. תלמידים אשר סובלים מנזלת כרונית נופלים בהישגיהם ב-40% מילדים אחרים.
