אחד הנושאים המרכזיים שבו מתקיים מתח מתמיד בין מערכת המשפט לבין הממשלה הוא הביטחון. המערכת המשפטית מעכבת או מונעת הרס של בתי מחבלים, כלי חשוב למאבק בטרור לתפיסתו של השר לביטחון פנים. אין מדובר כאן בשאלות תיאורטיות שמקומן באקדמיה, אלא בשאלות של חיים ומוות, בהן מכריעה מערכת המשפט. לעיתים הכרעות הבג"ץ מקוממות ציבור גדול במדינת ישראל, אולם לאזרחים אין השפעה על בית המשפט.
ככל הנראה, הירידה באימון הציבור במערכת המשפט, נובעת מחוסר הגיוון בבית המשפט. כיום לשופטים יש זכות וטו על מינוי שופטים והם מקפידים לשמור על "המשפחה", מפני בעלי דעות לאומיות [
ראה מאמר]. אולם בעקבות הרפורמה הדמוקרטית במערכת המשפט, השופטים יאבדו זכות וטו זו. גיוון בית המשפט יחזיר לו את האימון הציבורי שאיבד וכך יחזק את בית המשפט.
הרפורמה המשפטית דרושה באופן דחוף, כדי לאפשר את עצירת תוכנית פיאד לכיבוש שטחי C, שביצועה החל מזמן. עיכוב הרפורמה המשפטית עלול לסבך קשות את המצב בשטחי C.
כלי חשוב לחיזוק מדינת ישראל מול הטרור הוא ההתיישבות בנגב, ביהודה, בשומרון ובגליל. ההיסטוריה הציונית מלמדת שבמקום שבו תעבור המחרישה, משם לא יירו עלינו טילים. כדוגמה חיובית יש להציג את הכניסות של הצבא ושירות הביטחון הכללי לכפרים ביהודה ושומרון מידי לילה, דבר שמתאפשר בזכות הישובים היהודיים. אולם המערכת המשפטית מונעת הקמת יישובים בגליל כבר שלושים שנה (ראה ערך רמת ארבל)! כדי שהממשלה תוכל ליישם מדיניות של התיישבות, היא חייבת תחילה לחוקק את ארבעת החוקים שהעלה שר המשפטים, יריב לוין להסדרת מעמדהּ של מערכת המשפט.
ההתמודדות בהסתה במזרח ירושלים צפויה ליצור מתח חדש בין הממשלה לבג"ץ. שוב יש חשש שהבג"ץ יסכל את תוכניות הממשלה, שכל כך חיוניות לביטחון המדינה. גם חוק שלילת אזרחות של מחבלים עומד בספק אם יכובד על-ידי הבג"ץ. נותר לנו, להתחנן בפני העושים במלאכה: אסור לכם לחכות רגע. זו חובתכם כלפי כל האזרחים ובפרט כלפי מי שבחר בכם. למען ביטחון המדינה, האיצו את הרפורמה הדמוקרטית במערכת המשפט.