הרפואה ההומיאופתית מתמודדת ומטפלת במחלות החורף באופן שונה מהרפואה הרגילה. הטיפול ההומיאופתי מיועד לטפל בשורש הבעיה. בניגוד לתרופות כימיות אשר לדוגמא מפסיקות את תהליך הדלקתי בצורה מלאכותית, התרופה ההומיאופתית מגרה ומפעילה את מערכות הריפוי העצמיות. הריפוי הינו אמיתי ויסודי.
הסיבה העיקרית למחלות החורף היא מערכת חיסון שאינה תקינה. במצב תקין, החיידק או הנגיף אינם מסוגלים לגרום למחלה. לפיכך, הגישה הנכונה היא חיזוק ואיזון המערכת החיסונית.
קיימות מספר סיבות עיקריות לפגיעה במערכת החיסון: א. תורשה - יש אנשים שנולדים עם מערכת חיסון חלשה. לעיתים רק אזור מסוים בגוף רגיש ופגיע יותר (למשל האוזניים או הריאות). לעיתים אין מערכת מסוימת פגיעה ואז מופיעות מחלות שונות בכל פעם במקום אחר. רגישות זו הנה לעיתים משפחתית;
ב. תזונה לא נכונה - מחסור במרכיבים חיוניים מחליש את מערכת החיסון;
ג. גישת ההומיאופתיה הנה שמערכת החיסון עלולה להיפגע מתרופות שונות ומחיסונים;
ד. בעיה רגשית כמו: חוסר ביטחון שמוביל תחושות קשות אצל הילד, פחד נטישה, מריבות משפחתיות קשות ותכופות ועוד, עלולים לגרום לפגיעה ולהחלשה של המערכת החיסונית וכתוצאה מכך להתפתחות מחלות שונות.
הטיפול ההומיאופתי נבחר בהתאם לאפיונים הכללים של המחלה ואפיונים ספציפיים של החולה. לדוגמא: אם הילד סובל מחום גבוה, מצימאון ושלשול ומוגדר כילד שתמיד חם לו הוא יקבל תרופה מסוימת, בעוד שאם הילד סובל מאותם תסמינים שתוארו - למעט השינוי שתמיד קר לו, הוא יקבל קרוב לוודאי תרופה הומיאופתית אחרת. כמו גם, כאשר הבעיה נובעת, למשל מפחד או קנאה יבחר ההומיאופת תרופה שונה.
עם תחילת עונות מעבר, שינויי מזג האוויר מחלישים את המערכת החיסונית, בעיקר בקרב ילדים וקשישים, וישנה נטייה לסבול ממחלות אף אוזן גרון ודרכי נשימה חוזרות.